208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3103 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  100 
 
 		 276 aa  554  1e-157  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2351  methyltransferase type 11  34.73 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0117235  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  31.1 
 
 		 270 aa  102  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  32.92 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  32.39 
 
 		 269 aa  99.8  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  32.38 
 
 		 279 aa  97.4  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  32.06 
 
 		 279 aa  95.5  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  31.44 
 
 		 268 aa  93.2  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  23.83 
 
 		 283 aa  87  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1037  methyltransferase type 12  39.87 
 
 		 256 aa  86.3  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  26.82 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  37.37 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0207  hypothetical protein  26.43 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  29.6 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1481  hypothetical protein  32.89 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  27.51 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  29.33 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  27.71 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  26.79 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  27.71 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1271  hypothetical protein  27.64 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000529075  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  27.51 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  24.3 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  26.15 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  31.49 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  22.46 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  36.3 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  19.42 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  20.56 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  25.12 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  27.87 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  25.78 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  35.06 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  30.91 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  34.06 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  28.05 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0206  hypothetical protein  24.69 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0297191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  26.48 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  26.35 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  24.38 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  27.4 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  26.62 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  30 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  30.36 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  27.33 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  29.45 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0961  Methyltransferase type 11  31.39 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0435483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  30.37 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  29.53 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3896  methyltransferase type 11  37.7 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.744662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3030  methyltransferase type 12  34.39 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.59 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.75 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2634  hypothetical protein  24.39 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.167376  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1749  methyltransferase type 12  29.05 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.110719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8959  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  31.61 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0260  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 		 267 aa  57  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00488037  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  37.08 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0091  hypothetical protein  36.11 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0346514  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  28.86 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  30.56 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0834  Methyltransferase type 12  34.96 
 
 		 205 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2579  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 217 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000242226  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 333 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2399  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 210 aa  53.9  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.521103  normal  0.920683 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  39.74 
 
 		 329 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1029  methyltransferase type 11  29.85 
 
 		 210 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3506  methyltransferase type 11  31.31 
 
 		 299 aa  53.1  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 259 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.36 
 
 		 212 aa  52.4  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1797  flagellar basal-body rod protein  30.53 
 
 		 241 aa  52.4  0.000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.119466  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0514  methyltransferase domain-containing protein  29.09 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2897  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 189 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 272 aa  51.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0040  hypothetical protein  30.77 
 
 		 232 aa  51.2  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  36.17 
 
 		 210 aa  51.2  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2658  methyltransferase type 12  37.14 
 
 		 121 aa  50.4  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774781  normal  0.0322757 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3752  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 259 aa  50.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.51014  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0992  Methyltransferase type 11  48.15 
 
 		 255 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.358942  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  27.34 
 
 		 218 aa  49.3  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  24.71 
 
 		 221 aa  49.3  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  26.97 
 
 		 203 aa  48.9  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  31.93 
 
 		 215 aa  48.9  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 334 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0477  Methyltransferase type 11  28.69 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  37.5 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  29.84 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2361  methyltransferase type 12  28.15 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1045  hypothetical protein  25.93 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  32.89 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.67 
 
 		 259 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4055  putative methyltransferase  26.36 
 
 		 194 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4321  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.23 
 
 		 208 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701577  normal  0.237369 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1588  Methyltransferase type 12  31.82 
 
 		 293 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0308513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.298686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>