More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3852 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  100 
 
 
212 aa  442  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  40.1 
 
 
208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3896  methyltransferase type 11  34.98 
 
 
208 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.744662  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0834  Methyltransferase type 12  32.37 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1918  methyltransferase type 11  34.65 
 
 
229 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1749  methyltransferase type 12  34.47 
 
 
215 aa  115  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.110719  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4321  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.13 
 
 
208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701577  normal  0.237369 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4215  methyltransferase type 12  34.62 
 
 
208 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.515794  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3983  hypothetical protein  33.33 
 
 
206 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.117251  normal  0.595141 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2658  methyltransferase type 12  43.62 
 
 
121 aa  87.4  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774781  normal  0.0322757 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  29.24 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  27.7 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.16 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  31.16 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0855  Methyltransferase type 11  33.67 
 
 
240 aa  68.2  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.95 
 
 
234 aa  68.2  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2811  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.481855  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3572  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  33.55 
 
 
276 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
261 aa  67  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  28.87 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 
1759 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  32.89 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1029  methyltransferase type 11  24.47 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  29.71 
 
 
274 aa  65.1  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  27.98 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  27.88 
 
 
241 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2189  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.03 
 
 
229 aa  64.3  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  28.83 
 
 
415 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  37.37 
 
 
266 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.49 
 
 
255 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  26.7 
 
 
226 aa  63.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.13 
 
 
209 aa  63.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
273 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  34.95 
 
 
246 aa  63.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  32.39 
 
 
264 aa  63.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  29.94 
 
 
229 aa  62.8  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  33 
 
 
225 aa  63.2  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 
268 aa  62.4  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  34.31 
 
 
274 aa  62.8  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0085  Methyltransferase type 11  32.65 
 
 
236 aa  62.4  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  26.46 
 
 
207 aa  62  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2339  methyltransferase type 11  31.9 
 
 
191 aa  62  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.755854  normal  0.422901 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  29.49 
 
 
204 aa  61.6  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  31.58 
 
 
214 aa  61.6  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.09 
 
 
237 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0477  Methyltransferase type 11  33.91 
 
 
235 aa  61.2  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  29.49 
 
 
204 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.53 
 
 
250 aa  60.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1224  methyltransferase type 11  31.86 
 
 
282 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.158383  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  35.35 
 
 
265 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  34 
 
 
202 aa  60.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.09 
 
 
237 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  28.85 
 
 
204 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 
271 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.11 
 
 
234 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.15 
 
 
253 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0998  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  33.78 
 
 
230 aa  60.5  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0388  Methyltransferase type 11  26.23 
 
 
226 aa  60.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  27.59 
 
 
287 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  25.83 
 
 
266 aa  60.1  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  30.92 
 
 
238 aa  60.1  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0321  demethylmenaquinone methyltransferase  35.64 
 
 
216 aa  60.1  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  31.07 
 
 
398 aa  60.1  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  32 
 
 
237 aa  60.1  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  26.75 
 
 
219 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0464  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.41 
 
 
421 aa  59.7  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.26 
 
 
241 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
285 aa  59.7  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0591  Methyltransferase type 11  29.05 
 
 
263 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.812194 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  35.16 
 
 
255 aa  59.3  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1156  methyltransferase  33.04 
 
 
355 aa  59.3  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  26.4 
 
 
271 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  26.62 
 
 
204 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  26.62 
 
 
204 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  27.66 
 
 
255 aa  59.3  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  32.73 
 
 
282 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  28.57 
 
 
392 aa  58.9  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  31.09 
 
 
211 aa  59.3  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0492  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  27.52 
 
 
232 aa  58.9  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0826  methyltransferase type 11  28.86 
 
 
224 aa  58.9  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.457177  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  29.07 
 
 
270 aa  58.9  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  30.5 
 
 
210 aa  58.9  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  31.63 
 
 
272 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  26.62 
 
 
204 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  32.65 
 
 
240 aa  58.9  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.99 
 
 
259 aa  58.5  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 
390 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1392  putative S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  26.18 
 
 
208 aa  58.5  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0586874  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.38 
 
 
250 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  29.25 
 
 
273 aa  58.5  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
204 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.69 
 
 
283 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  26.14 
 
 
244 aa  58.2  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4785  Methyltransferase type 11  31.73 
 
 
267 aa  58.2  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 
270 aa  58.2  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  30.84 
 
 
209 aa  58.2  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>