More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2210 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  100 
 
 
203 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3244  methyltransferase type 11  64 
 
 
208 aa  236  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596392  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19610  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  68.85 
 
 
207 aa  234  5.0000000000000005e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0633091  normal  0.0668245 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2862  methyltransferase type 11  60 
 
 
207 aa  233  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5739  methyltransferase type 11  62 
 
 
208 aa  227  8e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3895  methyltransferase type 11  43.63 
 
 
198 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3903  methyltransferase type 11  43.63 
 
 
198 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  42 
 
 
204 aa  143  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  41.4 
 
 
205 aa  142  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  41.09 
 
 
204 aa  142  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  41.5 
 
 
204 aa  141  8e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  40.11 
 
 
204 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  40.32 
 
 
204 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  40.32 
 
 
204 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  40.32 
 
 
204 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  39.78 
 
 
204 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  42.7 
 
 
202 aa  124  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  36.61 
 
 
202 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2376  Methyltransferase type 11  39.68 
 
 
210 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578401  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  32.05 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  30.61 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  29.93 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  31.17 
 
 
347 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  33.11 
 
 
242 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  33.11 
 
 
242 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.77 
 
 
234 aa  67  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  33.79 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  38.02 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2635  Methyltransferase type 11  35.66 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  31.29 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  29.85 
 
 
235 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  28.95 
 
 
239 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  36.15 
 
 
264 aa  63.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  28.26 
 
 
202 aa  63.2  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 
244 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  35.21 
 
 
263 aa  62.4  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  31.01 
 
 
237 aa  62.4  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  37.61 
 
 
273 aa  62  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.8 
 
 
236 aa  62  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  27.01 
 
 
238 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.74 
 
 
236 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 
199 aa  61.6  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  29.01 
 
 
249 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.74 
 
 
238 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  29.73 
 
 
241 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  35.59 
 
 
252 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  31.21 
 
 
236 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  33.58 
 
 
251 aa  60.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 
190 aa  60.5  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  26.28 
 
 
235 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  35.78 
 
 
246 aa  60.1  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  29.3 
 
 
242 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  30.2 
 
 
199 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  27.82 
 
 
235 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 
239 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3885  methyltransferase type 11  27.06 
 
 
274 aa  59.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  28.69 
 
 
241 aa  59.3  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1091  methyltransferase type 11  33.53 
 
 
273 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.117678 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  41.12 
 
 
352 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  35.59 
 
 
260 aa  58.2  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  25.38 
 
 
250 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  39.6 
 
 
263 aa  57.8  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  39.6 
 
 
263 aa  57.8  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  39.6 
 
 
263 aa  57.8  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3113  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 
350 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00520497  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  34.26 
 
 
310 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.58 
 
 
273 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  38.26 
 
 
348 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  37.17 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1262  type 11 methyltransferase  32.35 
 
 
273 aa  57.8  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.653357  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.58 
 
 
205 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1612  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.93 
 
 
356 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 
265 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  38 
 
 
264 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0896  Methyltransferase type 11  29.8 
 
 
350 aa  57  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  36.52 
 
 
210 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  38.39 
 
 
274 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1003  methyltransferase type 11  33.59 
 
 
180 aa  57  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00822165  normal  0.0267075 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0834  Methyltransferase type 12  37.82 
 
 
205 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 
1106 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.75 
 
 
257 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  33.79 
 
 
279 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 
261 aa  56.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  34.45 
 
 
195 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  26.49 
 
 
328 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  26.04 
 
 
270 aa  56.2  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00761  hypothetical protein  28.77 
 
 
246 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286204  normal  0.107855 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0786  hypothetical protein  29.46 
 
 
242 aa  56.2  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.27206  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  31.78 
 
 
400 aa  55.8  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 
269 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1922  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 
226 aa  55.8  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  38 
 
 
267 aa  55.8  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.16 
 
 
258 aa  56.2  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2605  hypothetical protein  28.28 
 
 
265 aa  55.5  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  28.36 
 
 
208 aa  55.5  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2339  methyltransferase type 11  33.63 
 
 
191 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.755854  normal  0.422901 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3557  Methyltransferase type 11  31.15 
 
 
369 aa  55.5  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2111  methyltransferase type 11  26.79 
 
 
224 aa  55.5  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296971 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  30.09 
 
 
200 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1915  methyltransferase type 11  35.85 
 
 
267 aa  55.5  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0565033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>