More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5124 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  100 
 
 		 241 aa  484  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  99.17 
 
 		 241 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  86.31 
 
 		 241 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4832  methyltransferase type 11  85.42 
 
 		 270 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3334  methyltransferase type 11  85.42 
 
 		 270 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4181  methyltransferase type 11  85.42 
 
 		 270 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2180  putative methyltransferase  46.32 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  37.95 
 
 		 252 aa  99.8  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  40.52 
 
 		 264 aa  92.4  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  30.83 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  31.27 
 
 		 280 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  39.2 
 
 		 260 aa  85.5  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  36.26 
 
 		 236 aa  85.1  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 264 aa  85.1  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  37.58 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  38.73 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  33.18 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.78 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  31.33 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  25.32 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  31.73 
 
 		 266 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  38.41 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0699  Methyltransferase type 11  35.03 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0634895  normal  0.912408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  34.5 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  32.05 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  40.71 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  35.29 
 
 		 262 aa  72  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.01 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  42.57 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  42.24 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0061  Orf34  33.87 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  42.27 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  44.21 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1562  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.87 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1474  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.87 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0302671  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  42.11 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.56 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  33.82 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.36 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  38.53 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  37.96 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  39.42 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  35.2 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2104  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0094319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.76 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  34.04 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  26.27 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  44.86 
 
 		 276 aa  68.6  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  38.97 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  33.89 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  33.33 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2699  methyltransferase type 12  27.84 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 272 aa  67  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  26.4 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  29.63 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  37.96 
 
 		 251 aa  67  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  37.61 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.24 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  37.61 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  37.61 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  37.96 
 
 		 251 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4780  methyltransferase type 11  36 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0464151  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.62 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1304  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.68 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308237  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  31.95 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  37.96 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 226 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  37.96 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  35.53 
 
 		 299 aa  67  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  41.28 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  27.4 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  42.71 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  38.71 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  44.04 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  42.57 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  28.39 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  34.71 
 
 		 311 aa  65.5  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2281  Methyltransferase type 11  36.59 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  37.84 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  25.74 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  37.04 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  37.04 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  37.04 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  39.29 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  42.27 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.05 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  37.04 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.15 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  37.04 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2198  Methyltransferase type 11  35.39 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.77 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  42.16 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>