More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1811 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1811  Methyltransferase type 11  100 
 
 
235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0223  SAM-dependent methyltransferase  35.81 
 
 
242 aa  149  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  38.79 
 
 
233 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3437  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  36.77 
 
 
225 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1001  methyltransferase type 11  37.07 
 
 
237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1472  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 
242 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3142  Methyltransferase type 11  31.47 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1577  methyltransferase type 11  36.22 
 
 
301 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0911179  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  37.95 
 
 
307 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3542  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.56 
 
 
243 aa  98.2  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1312  methyltransferase type 11  30.8 
 
 
303 aa  98.2  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.117711  hitchhiker  0.0001856 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.51 
 
 
261 aa  97.8  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1806  hypothetical protein  31.53 
 
 
228 aa  96.7  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.727626  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1820  Methyltransferase type 11  41.03 
 
 
315 aa  95.1  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1612  Methyltransferase type 11  30.24 
 
 
233 aa  87.8  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2617  Methyltransferase type 11  30.5 
 
 
228 aa  86.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  30.96 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  40.8 
 
 
239 aa  72  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3269  methyltransferase type 11  28.36 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20677  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  31.9 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3273  Methyltransferase type 12  25.23 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 
232 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  35 
 
 
204 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3607  hypothetical protein  28.89 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.82 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  40.2 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  35 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2241  methyltransferase type 11  30.37 
 
 
239 aa  67  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.48 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  26.56 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3600  hypothetical protein  28.15 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1107  Methyltransferase type 11  41.94 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.000000024233 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  32.56 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
293 aa  65.5  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1625  hypothetical protein  29.1 
 
 
239 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.207342 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 
225 aa  64.7  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  47.78 
 
 
457 aa  64.7  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  33.04 
 
 
202 aa  63.9  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
248 aa  64.3  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  31.76 
 
 
202 aa  63.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3339  methyltransferase  26.87 
 
 
239 aa  63.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3290  methyltransferase  24.48 
 
 
239 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
215 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3693  hypothetical protein  27.41 
 
 
239 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336986  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  31.95 
 
 
237 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3590  hypothetical protein  29.17 
 
 
239 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.15692 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  33.04 
 
 
204 aa  62.4  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  40.82 
 
 
268 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
254 aa  62.4  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  30.46 
 
 
265 aa  62.4  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
239 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  42.57 
 
 
364 aa  62.4  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
254 aa  62  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  25.64 
 
 
253 aa  62  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  25.64 
 
 
253 aa  62  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  37.96 
 
 
218 aa  62  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  35.96 
 
 
244 aa  61.6  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
239 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  37.89 
 
 
305 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3113  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 
350 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00520497  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.04 
 
 
277 aa  61.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  30.28 
 
 
1005 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0182  Methyltransferase type 11  36.54 
 
 
263 aa  61.2  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0334724  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  29.22 
 
 
202 aa  61.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04625  arsenic methyltransferase Cyt19, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G15020)  33.9 
 
 
282 aa  60.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3376  hypothetical protein  27.78 
 
 
239 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  38.54 
 
 
319 aa  60.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3641  hypothetical protein  27.78 
 
 
239 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 
275 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  29.1 
 
 
271 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  36.27 
 
 
341 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  30.91 
 
 
284 aa  60.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  35.94 
 
 
256 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  33.61 
 
 
205 aa  60.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.7 
 
 
265 aa  60.1  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  31.63 
 
 
211 aa  60.1  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2736  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 
225 aa  60.1  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 
226 aa  60.1  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  37.25 
 
 
276 aa  59.7  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
271 aa  59.7  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 
248 aa  59.7  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  36.46 
 
 
290 aa  59.7  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  23.7 
 
 
301 aa  59.3  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4190  Methyltransferase type 12  35.96 
 
 
208 aa  59.3  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.278739  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  26.44 
 
 
280 aa  59.3  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  39.18 
 
 
291 aa  58.9  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  32.39 
 
 
258 aa  58.9  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  41.18 
 
 
284 aa  58.5  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  28.28 
 
 
201 aa  58.5  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1922  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 
226 aa  58.5  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  30.91 
 
 
276 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1224  methyltransferase type 11  35.66 
 
 
282 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.158383  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  38.74 
 
 
258 aa  58.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  35.78 
 
 
242 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  38.61 
 
 
246 aa  58.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.35 
 
 
258 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  34.82 
 
 
276 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  35.78 
 
 
242 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0474  methyltransferase type 11  30.61 
 
 
217 aa  57.8  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00410704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>