More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3790 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  100 
 
 		 196 aa  388  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2635  Methyltransferase type 11  50.25 
 
 		 199 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0767  Methyltransferase type 11  43.65 
 
 		 194 aa  137  7.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.763548  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2318  methyltransferase type 11  36.46 
 
 		 187 aa  91.3  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0735638 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13866  hypothetical protein  36.31 
 
 		 191 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2786  Methyltransferase type 11  34.44 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0321323 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4394  Methyltransferase type 11  33.7 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  36.18 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  36.18 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  30.07 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.65 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  37.84 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  34.57 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  37.84 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  33.54 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  37.17 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  33.03 
 
 		 202 aa  72  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  42.72 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  31.54 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  29.14 
 
 		 268 aa  68.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  29.14 
 
 		 268 aa  68.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  37.3 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.62 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.355376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4780  methyltransferase type 11  28.86 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0464151  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.79 
 
 		 261 aa  65.1  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2862  methyltransferase type 11  30.89 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  40.19 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.67 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  39.18 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  37.91 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3603  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000473766 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  39.29 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0064  Methyltransferase type 11  34.76 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0393  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  25.97 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  29.92 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  34.48 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.61 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.205211 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.36 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3415  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.62 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  40 
 
 		 347 aa  62  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 332 aa  62  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5061  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.81 
 
 		 256 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1262  type 11 methyltransferase  30.63 
 
 		 273 aa  61.6  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.653357  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2414  hypothetical protein  30.05 
 
 		 351 aa  62  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177274  normal  0.0190439 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  33.01 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  34 
 
 		 276 aa  62  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 341 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4848  Methyltransferase type 11  35.64 
 
 		 310 aa  62  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 		 331 aa  61.6  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  37.01 
 
 		 259 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  38.78 
 
 		 327 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0103  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.05 
 
 		 249 aa  61.2  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.881721  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5011  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.81 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0289  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  35.71 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  34.27 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  29.13 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4885  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.81 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0466  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.71 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  27.56 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  27.57 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0323  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  33.33 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  39.22 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.97 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4146  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.95 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.1 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.420732  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.13 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4216  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.95 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227535 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2653  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.56 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1167  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000217887  hitchhiker  0.00731668 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0454  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.27 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0799871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0746  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.55 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2700  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  31.58 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6936  putative cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.95 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389274  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4209  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  30.16 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5274  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.95 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.123369  normal  0.211011 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  38.78 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  34.76 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4305  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.95 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03675  hypothetical protein  28.97 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4175  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.95 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4354  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.95 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.556022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4057  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.95 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  37.23 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0402  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.67 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.866144  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.35 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4441  methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  33.55 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>