More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3263 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  100 
 
 
229 aa  468  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  42.98 
 
 
187 aa  93.2  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  31.65 
 
 
213 aa  86.3  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6701  UbiE/COQ5 methyltransferase  44 
 
 
223 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0474  methyltransferase type 11  35.4 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00410704  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0895  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.7 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195725 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
411 aa  79.3  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2014  methyltransferase type 11  40.91 
 
 
236 aa  79  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.51029  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.04 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3338  Methyltransferase type 11  40.38 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0025  methyltransferase type 11  36.76 
 
 
213 aa  77  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1596  Methyltransferase type 11  37.9 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  34.04 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  39.66 
 
 
253 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  34.09 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1167  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.61 
 
 
259 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000217887  hitchhiker  0.00731668 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  37.59 
 
 
200 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  39.29 
 
 
208 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1594  methyltransferase type 11  33.09 
 
 
218 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  37.59 
 
 
200 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  29.71 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31705  predicted protein  39.06 
 
 
163 aa  73.9  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.592624  normal  0.0686433 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
327 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.04 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  35.96 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  35.65 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  41.32 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1366  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.72 
 
 
235 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0509799  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.33 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.18 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.87 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0867  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE, putative  35.34 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  38.06 
 
 
305 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  38.79 
 
 
328 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.68 
 
 
245 aa  68.6  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  32.03 
 
 
293 aa  68.9  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  33.1 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6455  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.38 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.81 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  36.54 
 
 
236 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2048  hypothetical protein  34.95 
 
 
221 aa  68.2  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.94686e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
244 aa  68.2  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  36.54 
 
 
236 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  37.27 
 
 
233 aa  68.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0499  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.61 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6509  methyltransferase type 11  32.56 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5653  methyltransferase type 11  32.56 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6018  methyltransferase type 11  32.56 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.153765  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1468  methyltransferase type 11  37.9 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.197661  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4023  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.48 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  35.58 
 
 
236 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  35.58 
 
 
236 aa  67  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  37.88 
 
 
349 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.5 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  31.87 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  37.88 
 
 
354 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.74 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.45 
 
 
259 aa  67  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0632  type 11 methyltransferase  37.93 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.186651 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.59 
 
 
237 aa  67  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
339 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  31.25 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  31.65 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  37.12 
 
 
342 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
280 aa  67  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1686  methyltransferase  36.54 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.67028  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  42.16 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.45 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  38.05 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0725  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 
313 aa  65.9  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0157  putative methyltransferase  36.29 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  34.62 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  39.22 
 
 
276 aa  65.1  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1078  SAM-dependent methyltransferase  32.26 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.215412  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
196 aa  65.1  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0289  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  34.4 
 
 
261 aa  65.1  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1996  generic methyltransferase  32 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  28.25 
 
 
289 aa  65.1  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0466  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.4 
 
 
261 aa  65.1  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6134  methyltransferase type 11  31.78 
 
 
220 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145601  normal  0.0218248 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0468  hypothetical protein  37.5 
 
 
249 aa  64.7  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  31.94 
 
 
244 aa  64.3  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0984  methyltransferase type 11  33.08 
 
 
300 aa  64.7  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.83 
 
 
250 aa  64.7  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  33.58 
 
 
341 aa  64.3  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23770  putative biotin synthesis protein  40.96 
 
 
187 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0761957 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  32.12 
 
 
226 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  38.46 
 
 
254 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.45 
 
 
249 aa  64.7  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0960  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 
224 aa  64.7  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6852  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 
217 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18943  normal  0.739847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 
259 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0703  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  28.3 
 
 
221 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161122  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1464  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.38 
 
 
221 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.39 
 
 
271 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  31.47 
 
 
255 aa  63.5  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>