179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0960 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0960  Methyltransferase type 11  100 
 
 
224 aa  461  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2001  methyltransferase type 11  43.69 
 
 
238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323981  normal  0.165112 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2014  methyltransferase type 11  22.87 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.51029  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  27.22 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  28.95 
 
 
229 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  25.32 
 
 
205 aa  62.4  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  31.97 
 
 
305 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  27.03 
 
 
206 aa  59.3  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  31.82 
 
 
275 aa  57.4  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3590  hypothetical protein  29.49 
 
 
239 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.15692 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.33 
 
 
213 aa  55.5  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  24.86 
 
 
280 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0895  UbiE/COQ5 methyltransferase  23.47 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195725 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3607  hypothetical protein  28.03 
 
 
239 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3600  hypothetical protein  28.03 
 
 
239 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  24.36 
 
 
257 aa  53.5  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  29.89 
 
 
207 aa  53.5  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
309 aa  52  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3290  methyltransferase  28.85 
 
 
239 aa  52  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3376  hypothetical protein  28.57 
 
 
239 aa  51.6  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3641  hypothetical protein  28.57 
 
 
239 aa  51.6  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0120  Methyltransferase type 12  21.51 
 
 
224 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  25.54 
 
 
305 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  25.45 
 
 
307 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  33.66 
 
 
207 aa  50.8  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  26.09 
 
 
341 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2147  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
213 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  24.85 
 
 
341 aa  50.1  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  21.83 
 
 
270 aa  49.7  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  24.59 
 
 
273 aa  49.7  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0474  methyltransferase type 11  24.43 
 
 
217 aa  49.7  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00410704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1625  hypothetical protein  26.28 
 
 
239 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.207342 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
207 aa  48.9  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  23.88 
 
 
212 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  25.45 
 
 
204 aa  48.9  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  25.45 
 
 
204 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51145  predicted protein  28.24 
 
 
363 aa  48.5  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  24.24 
 
 
341 aa  48.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3339  methyltransferase  28.03 
 
 
239 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  25.99 
 
 
310 aa  48.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  25.53 
 
 
272 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3440  Methyltransferase type 11  25.36 
 
 
256 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  27.05 
 
 
256 aa  47.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  29.2 
 
 
205 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  23.12 
 
 
277 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  24.7 
 
 
204 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  25 
 
 
209 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  23.65 
 
 
283 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0721  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  25.74 
 
 
204 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.635481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2298  Methyltransferase type 11  22.22 
 
 
306 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.490021 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3693  hypothetical protein  26.11 
 
 
239 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336986  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2043  methyltransferase type 11  21.35 
 
 
249 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2376  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  25.74 
 
 
204 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  24.1 
 
 
204 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2021  Methyltransferase type 11  20.33 
 
 
268 aa  46.6  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.45 
 
 
299 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  24.18 
 
 
312 aa  46.6  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  26.36 
 
 
264 aa  46.6  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  23.7 
 
 
277 aa  46.6  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3114  Methyltransferase type 11  22.58 
 
 
262 aa  46.6  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000861338  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  35 
 
 
274 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00203  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.2 
 
 
207 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  21.69 
 
 
262 aa  46.2  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4690  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  28.44 
 
 
206 aa  46.2  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00208  hypothetical protein  27.2 
 
 
207 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3154  hypothetical protein  22.08 
 
 
221 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0680  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.87 
 
 
239 aa  45.8  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.15 
 
 
207 aa  45.8  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0124  UbiE/COQ5 family methlytransferase  22.08 
 
 
221 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.528868  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1464  UbiE/COQ5 family methlytransferase  22.08 
 
 
221 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0519  UbiE/COQ5 family methlytransferase  22.08 
 
 
221 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.421388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0537  UbiE/COQ5 family methlytransferase  22.08 
 
 
221 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2892  UbiE/COQ5 family methlytransferase  22.08 
 
 
221 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.23 
 
 
256 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.23 
 
 
256 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.15 
 
 
207 aa  45.4  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  26.55 
 
 
312 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  27.91 
 
 
254 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  28.69 
 
 
253 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3145  hypothetical protein  28.69 
 
 
204 aa  45.4  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.725921  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.91 
 
 
254 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0419  hypothetical protein  23.7 
 
 
230 aa  45.4  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.271566 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  23.77 
 
 
351 aa  45.4  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1487  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
207 aa  45.4  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  21.71 
 
 
284 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3296  hypothetical protein  28.69 
 
 
212 aa  45.4  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.114197  normal  0.0687983 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  25.66 
 
 
311 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3398  Methyltransferase type 11  26.23 
 
 
207 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  25 
 
 
216 aa  45.1  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0254  methyltransferase type 11  23.6 
 
 
230 aa  45.1  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.753586 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0330  methyltransferase type 11  32.39 
 
 
199 aa  45.4  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  24.6 
 
 
347 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3455  methyltransferase type 11  27.2 
 
 
207 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.915003  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.83 
 
 
229 aa  45.1  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.416549  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
261 aa  45.1  0.0009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  24.56 
 
 
237 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  25.15 
 
 
286 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23770  putative biotin synthesis protein  25.6 
 
 
187 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0761957 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0632  type 11 methyltransferase  20.83 
 
 
204 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.186651 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>