208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2001 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2001  methyltransferase type 11  100 
 
 		 238 aa  487  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323981  normal  0.165112 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0960  Methyltransferase type 11  43.69 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2014  methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.51029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0895  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.14 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195725 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  30.84 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  26.49 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  26.53 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23770  putative biotin synthesis protein  33.65 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0761957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  27.7 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 411 aa  57  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  26.13 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  27.43 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 305 aa  53.1  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3440  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 		 256 aa  52.8  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1596  Methyltransferase type 11  26.23 
 
 		 217 aa  52.4  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  23.64 
 
 		 272 aa  52.4  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 341 aa  51.6  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0381  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 341 aa  50.8  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  30.28 
 
 		 258 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1936  methyltransferase type 11  24.42 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227883  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.59 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 341 aa  50.8  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 327 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0160  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.03 
 
 		 293 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5564  methyltransferase type 11  31.97 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  23.66 
 
 		 386 aa  50.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6701  UbiE/COQ5 methyltransferase  24.29 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.17 
 
 		 296 aa  49.7  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  24.48 
 
 		 275 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.08 
 
 		 258 aa  49.7  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.251701  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  23.78 
 
 		 270 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  25.45 
 
 		 272 aa  49.3  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6478  methyltransferase type 11  24.66 
 
 		 269 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0560724  normal  0.10851 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 246 aa  48.5  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1567  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.33 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00051335  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  24.66 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  25.69 
 
 		 328 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1285  Methyltransferase type 11  25.81 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1124  methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000131299  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0474  methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00410704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1605  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.33 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000158565  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00203  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.97 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3398  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1352  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.33 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.52 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3550  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.49 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1499  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.33 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0560874  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1462  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.33 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.114073  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3296  hypothetical protein  30.19 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.114197  normal  0.0687983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2189  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  27.89 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  23.12 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1535  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.33 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000727979 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  27.87 
 
 		 263 aa  47  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  23.93 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.97 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  25.27 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.97 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  27.19 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.97 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00208  hypothetical protein  31.97 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0402  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.67 
 
 		 200 aa  47  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  26 
 
 		 199 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  32.08 
 
 		 244 aa  46.6  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2048  hypothetical protein  27.18 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.94686e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3284  methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 173 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.859694  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  22.83 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  27.93 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  29.81 
 
 		 207 aa  47  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  24.17 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3145  hypothetical protein  30.19 
 
 		 204 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.725921  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  30.16 
 
 		 253 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  30.16 
 
 		 253 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0094  SAM-dependent methyltransferase  24.2 
 
 		 227 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.333279  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.04 
 
 		 232 aa  46.6  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.25 
 
 		 280 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  26.4 
 
 		 200 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.15 
 
 		 256 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0587  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.4 
 
 		 261 aa  45.8  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846793  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  26.4 
 
 		 200 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0454  methyltransferase type 11  24.03 
 
 		 321 aa  45.8  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.4 
 
 		 259 aa  45.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  23.24 
 
 		 272 aa  45.8  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  21.79 
 
 		 252 aa  45.4  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0106  putative methyl transferase  25.89 
 
 		 205 aa  45.4  0.0007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1367  methyltransferase type 11  29.01 
 
 		 258 aa  45.8  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000820801  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  22.58 
 
 		 254 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  23.2 
 
 		 253 aa  45.4  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  22.58 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0703  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  27.56 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161122  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 286 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0206  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.15 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2147  methyltransferase type 11  26.72 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07721  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.9 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>