161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0254 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0254  methyltransferase type 11  100 
 
 		 230 aa  481  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.753586 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0419  hypothetical protein  93.04 
 
 		 230 aa  444  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.271566 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10913  hypothetical protein  30.34 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127289  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2036  Methyltransferase type 12  29.75 
 
 		 231 aa  105  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3795  SAM-dependent methyltransferase  30.8 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3807  methyltransferase type 12  28.03 
 
 		 237 aa  99.8  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1686  SAM-dependent methyltransferase  29.21 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0634865 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2728  SAM-dependent methyltransferase  25.81 
 
 		 252 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3186  Methyltransferase type 12  26.78 
 
 		 245 aa  87.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.458893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5034  Methyltransferase type 12  25.53 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1026  Methyltransferase type 11  25.7 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1341  hypothetical protein  25.83 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3234  Methyltransferase type 11  25.23 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2534  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  27.92 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.115173 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2113  Methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.294106  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04540  hypothetical protein  27.37 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4711  methyltransferase type 12  24.85 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18721  hypothetical protein  22.41 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1187  methyltransferase type 12  27.81 
 
 		 236 aa  71.6  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.683233 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1513  hypothetical protein  23.04 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  0.422698 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1092  methyltransferase type 11  28.32 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1938  hypothetical protein  26.54 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000329837 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2197  hypothetical protein  26.47 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  28.08 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  40.2 
 
 		 344 aa  55.5  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  26.56 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  31.01 
 
 		 275 aa  52.8  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2808  hypothetical protein  26.01 
 
 		 248 aa  52.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0677099  normal  0.911187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  25.74 
 
 		 416 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 235 aa  52  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  37.84 
 
 		 360 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  23.57 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  23.88 
 
 		 283 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.15 
 
 		 215 aa  50.4  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  38.98 
 
 		 418 aa  50.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  30.49 
 
 		 275 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  27.21 
 
 		 356 aa  48.9  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0315  hypothetical protein  25.77 
 
 		 223 aa  48.5  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  26.76 
 
 		 317 aa  48.5  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1832  methyltransferase type 11  25.74 
 
 		 203 aa  48.5  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0705  Methyltransferase type 11  23.48 
 
 		 300 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  23.53 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1199  hypothetical protein  23.26 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.105724  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2956  methyltransferase type 11  26.72 
 
 		 304 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626473  normal  0.0682436 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  26.79 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18910  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  21.78 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.07476  normal  0.315555 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  25.86 
 
 		 311 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  29.27 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  33.33 
 
 		 356 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  28.09 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  32.56 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.5 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1199  methyltransferase type 11  40.82 
 
 		 286 aa  47  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  32.56 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  28.22 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  26.15 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  26.36 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  26.36 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  26.36 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0650  hypothetical protein  46.51 
 
 		 272 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.57 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  26.36 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  26.36 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  26.36 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  26.36 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17780  hypothetical protein  23.74 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.656728  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  26.83 
 
 		 270 aa  46.6  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  28.7 
 
 		 365 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0924  Methyltransferase type 11  28.83 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.45 
 
 		 296 aa  45.8  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1290  Methyltransferase type 12  27.68 
 
 		 341 aa  46.2  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  0.108647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4741  methyltransferase type 11  25.11 
 
 		 305 aa  45.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.168171 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2066  Methyltransferase type 12  27.46 
 
 		 441 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2040  Methyltransferase type 12  27.46 
 
 		 441 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  26.74 
 
 		 234 aa  45.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  27.08 
 
 		 402 aa  45.4  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08531  conserved hypothetical protein  30 
 
 		 305 aa  45.4  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.345186 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4447  Methyltransferase type 11  26.88 
 
 		 219 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0960  Methyltransferase type 11  23.6 
 
 		 224 aa  45.1  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0834  hypothetical protein  28.57 
 
 		 239 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.59 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  24.79 
 
 		 265 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0881  hypothetical protein  31.25 
 
 		 183 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.421379  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  24.3 
 
 		 355 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  35.09 
 
 		 361 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1430  modification methylase, HemK family  27.16 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000467016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  27.27 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1683  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  32.99 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0314  putative methyltransferase  23.89 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2577  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.98 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2906  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.23 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.68 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  25.97 
 
 		 357 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3338  Methyltransferase type 11  26.55 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0106  putative methyl transferase  38.3 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0696  methyltransferase  26.79 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003041  hypothetical protein  24.53 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>