34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2728 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2728  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 
252 aa  522  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1686  SAM-dependent methyltransferase  75.2 
 
 
263 aa  401  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0634865 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2534  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  45.31 
 
 
241 aa  220  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.115173 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3795  SAM-dependent methyltransferase  43.75 
 
 
230 aa  201  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2036  Methyltransferase type 12  42.86 
 
 
231 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916897  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3807  methyltransferase type 12  29.39 
 
 
237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5034  Methyltransferase type 12  27.87 
 
 
237 aa  121  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3186  Methyltransferase type 12  29.66 
 
 
245 aa  115  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.458893  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3234  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 
235 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1026  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10913  hypothetical protein  27.24 
 
 
236 aa  100  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127289  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1187  methyltransferase type 12  30.73 
 
 
236 aa  98.2  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.683233 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18721  hypothetical protein  26.36 
 
 
239 aa  92.4  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0254  methyltransferase type 11  25.81 
 
 
230 aa  89.4  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.753586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4711  methyltransferase type 12  26.95 
 
 
217 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1341  hypothetical protein  24.89 
 
 
238 aa  86.7  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0419  hypothetical protein  26.29 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.271566 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2113  Methyltransferase type 12  26.4 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.294106  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1092  methyltransferase type 11  25.54 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04540  hypothetical protein  23.53 
 
 
237 aa  59.7  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1513  hypothetical protein  23.43 
 
 
221 aa  59.3  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  0.422698 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0502  Methyltransferase type 12  22.27 
 
 
299 aa  55.8  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.510695 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18910  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  20.27 
 
 
268 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.07476  normal  0.315555 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1982  Methyltransferase type 12  22.98 
 
 
311 aa  54.3  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0266324  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3633  hypothetical protein  21.76 
 
 
213 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.697979 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2675  hypothetical protein  23.66 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0508  methyltransferase type 12  22.83 
 
 
316 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.16741  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1938  hypothetical protein  22.27 
 
 
232 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000329837 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0772  Methyltransferase type 12  22.1 
 
 
310 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3390  hypothetical protein  23.66 
 
 
239 aa  45.8  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1673  hypothetical protein  20.31 
 
 
312 aa  45.4  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0378  hypothetical protein  24.63 
 
 
401 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2197  hypothetical protein  20.63 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0465  methyltransferase type 12  25 
 
 
320 aa  43.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.691055  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>