22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3390 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3390  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2675  hypothetical protein  40.41 
 
 
253 aa  155  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3633  hypothetical protein  35.19 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.697979 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2113  Methyltransferase type 12  30 
 
 
240 aa  55.5  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.294106  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1513  hypothetical protein  27.4 
 
 
221 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  0.422698 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10913  hypothetical protein  22.9 
 
 
236 aa  50.1  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127289  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2728  SAM-dependent methyltransferase  23.66 
 
 
252 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3807  methyltransferase type 12  21.86 
 
 
237 aa  48.9  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2036  Methyltransferase type 12  24.77 
 
 
231 aa  48.9  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916897  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1686  SAM-dependent methyltransferase  24.11 
 
 
263 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0634865 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5034  Methyltransferase type 12  24.77 
 
 
237 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3186  Methyltransferase type 12  26.27 
 
 
245 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.458893  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1187  methyltransferase type 12  28.31 
 
 
236 aa  45.8  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.683233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2534  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  24.8 
 
 
241 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.115173 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0372  methyltransferase type 12  25.37 
 
 
441 aa  45.4  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04540  hypothetical protein  28.11 
 
 
237 aa  45.4  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3795  SAM-dependent methyltransferase  22.94 
 
 
230 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0419  hypothetical protein  20.85 
 
 
230 aa  45.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.271566 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3123  hypothetical protein  31.17 
 
 
426 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000940695  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2050  O-methyltransferase family 2  33.01 
 
 
377 aa  42.7  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141136 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3066  MCP methyltransferase, CheR-type  33.96 
 
 
4483 aa  42.7  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1938  hypothetical protein  28.5 
 
 
232 aa  42.4  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000329837 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>