48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5034 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5034  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 237 aa  493  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3807  methyltransferase type 12  55.51 
 
 		 237 aa  298  7e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3186  Methyltransferase type 12  52.56 
 
 		 245 aa  265  5e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.458893  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10913  hypothetical protein  42.79 
 
 		 236 aa  195  6e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127289  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1686  SAM-dependent methyltransferase  29.8 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0634865 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3795  SAM-dependent methyltransferase  32.16 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2728  SAM-dependent methyltransferase  27.87 
 
 		 252 aa  121  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2036  Methyltransferase type 12  30.26 
 
 		 231 aa  119  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3234  Methyltransferase type 11  30.54 
 
 		 235 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2534  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  27.73 
 
 		 241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.115173 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1026  Methyltransferase type 11  30.35 
 
 		 235 aa  109  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1187  methyltransferase type 12  29.15 
 
 		 236 aa  85.1  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.683233 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0254  methyltransferase type 11  25.53 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.753586 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0419  hypothetical protein  26.67 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.271566 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2808  hypothetical protein  30.05 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0677099  normal  0.911187 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1341  hypothetical protein  24.78 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18910  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  28.97 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.07476  normal  0.315555 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18721  hypothetical protein  22.37 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1092  methyltransferase type 11  28.05 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4711  methyltransferase type 12  25.75 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2197  hypothetical protein  27.65 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1938  hypothetical protein  26.32 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000329837 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2113  Methyltransferase type 12  24.24 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.294106  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04540  hypothetical protein  24.86 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1513  hypothetical protein  22.61 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  0.422698 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0252  hypothetical protein  22.27 
 
 		 301 aa  53.1  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3695  methyltransferase type 12  30.47 
 
 		 726 aa  49.3  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  31.73 
 
 		 243 aa  45.8  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3372  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  25.83 
 
 		 378 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  31.07 
 
 		 206 aa  45.4  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0502  Methyltransferase type 12  20.92 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.510695 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2303  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 390 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.342078  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3633  hypothetical protein  24.12 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.697979 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  24.24 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  27.03 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2675  hypothetical protein  23.28 
 
 		 253 aa  43.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2296  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  26.32 
 
 		 382 aa  43.9  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  25.42 
 
 		 250 aa  42.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3338  Methyltransferase type 11  27.45 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2605  hypothetical protein  26.37 
 
 		 265 aa  43.1  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  27.07 
 
 		 263 aa  42.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0934  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  25 
 
 		 402 aa  42.7  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2642  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 390 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350923  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2732  hypothetical protein  27.47 
 
 		 265 aa  42.4  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  26.32 
 
 		 309 aa  42  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1078  SAM-dependent methyltransferase  28.75 
 
 		 201 aa  42  0.009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.215412  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1278  hypothetical protein  22.05 
 
 		 226 aa  41.6  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>