22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0502 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0502  Methyltransferase type 12  100 
 
 
299 aa  610  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.510695 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0465  methyltransferase type 12  54.55 
 
 
320 aa  308  8e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.691055  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0772  Methyltransferase type 12  49.83 
 
 
310 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0508  methyltransferase type 12  48.49 
 
 
316 aa  286  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.16741  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1982  Methyltransferase type 12  46.82 
 
 
311 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0266324  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0252  hypothetical protein  45.64 
 
 
301 aa  266  4e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1673  hypothetical protein  43.48 
 
 
312 aa  248  1e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1341  hypothetical protein  24.57 
 
 
238 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18721  hypothetical protein  26.11 
 
 
239 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2728  SAM-dependent methyltransferase  22.27 
 
 
252 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3807  methyltransferase type 12  21.55 
 
 
237 aa  53.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1686  SAM-dependent methyltransferase  25.56 
 
 
263 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0634865 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1326  methyltransferase type 11  24.12 
 
 
243 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.517488 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5469  methyltransferase type 11  24.14 
 
 
244 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12009  hypothetical protein  24.14 
 
 
282 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1938  hypothetical protein  24.52 
 
 
232 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000329837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5034  Methyltransferase type 12  20.92 
 
 
237 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.09 
 
 
237 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18910  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  27.03 
 
 
268 aa  43.5  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.07476  normal  0.315555 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4963  methyltransferase type 12  23.35 
 
 
255 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4874  methyltransferase type 12  23.35 
 
 
255 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.983195  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2113  Methyltransferase type 12  23.61 
 
 
240 aa  42.4  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.294106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>