55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12009 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12009  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  569  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5469  methyltransferase type 11  52.33 
 
 		 244 aa  247  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5242  methyltransferase type 11  54.89 
 
 		 255 aa  235  6e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4874  methyltransferase type 12  54.47 
 
 		 255 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.983195  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4963  methyltransferase type 12  54.47 
 
 		 255 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1326  methyltransferase type 11  47.86 
 
 		 243 aa  208  9e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.517488 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0252  hypothetical protein  28.02 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1982  Methyltransferase type 12  28.51 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0266324  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1262  type 11 methyltransferase  33.96 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.653357  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0772  Methyltransferase type 12  27.31 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0502  Methyltransferase type 12  24.23 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.510695 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1937  hypothetical protein  25.21 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.511504  normal  0.0833861 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1026  Methyltransferase type 11  26.83 
 
 		 235 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3234  Methyltransferase type 11  29.71 
 
 		 235 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  27.65 
 
 		 832 aa  50.4  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0508  methyltransferase type 12  28.19 
 
 		 316 aa  49.7  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.16741  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1844  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 225 aa  49.7  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00648646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4615  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 253 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369451  hitchhiker  0.00577635 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  29.19 
 
 		 196 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 317 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0767  Methyltransferase type 11  28.8 
 
 		 194 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.763548  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1197  methyltransferase type 12  33.68 
 
 		 223 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.500309 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 211 aa  46.6  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1085  methyltransferase type 12  28.8 
 
 		 235 aa  46.6  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2862  methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 207 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  35.25 
 
 		 204 aa  45.8  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1137  transcriptional regulator  31.67 
 
 		 395 aa  45.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000736319  hitchhiker  0.00587761 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6101  methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 214 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  33.87 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2354  methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 231 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.202193  normal  0.578326 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2014  methyltransferase type 11  24.34 
 
 		 236 aa  43.9  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.51029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  27.8 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0950  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  24.5 
 
 		 230 aa  43.9  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.512948  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 266 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  30.26 
 
 		 311 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  33.87 
 
 		 204 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 273 aa  43.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 269 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 283 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3788  type 11 methyltransferase  31.75 
 
 		 306 aa  42.7  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3130  hypothetical protein  33.04 
 
 		 305 aa  42.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0717  Methyltransferase type 12  36.25 
 
 		 238 aa  42.7  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  27.55 
 
 		 215 aa  42.7  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1255  Methyltransferase type 11  28.28 
 
 		 154 aa  42.7  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  32.38 
 
 		 267 aa  42.7  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3768  hypothetical protein  28.21 
 
 		 267 aa  42.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3137  methyltransferase type 11  38.75 
 
 		 256 aa  42.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474938  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1336  O-methyltransferase family protein  29.01 
 
 		 339 aa  42.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0282935  normal  0.0183052 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  35.8 
 
 		 225 aa  42.4  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  27.91 
 
 		 207 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  27.91 
 
 		 207 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 204 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>