31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0252 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0252  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  620  1e-177  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0772  Methyltransferase type 12  52.35 
 
 
310 aa  320  9.999999999999999e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1982  Methyltransferase type 12  50.5 
 
 
311 aa  291  1e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0266324  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0508  methyltransferase type 12  50.84 
 
 
316 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.16741  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0502  Methyltransferase type 12  45.64 
 
 
299 aa  266  4e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.510695 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0465  methyltransferase type 12  42.67 
 
 
320 aa  214  9.999999999999999e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.691055  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1673  hypothetical protein  37.67 
 
 
312 aa  187  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18721  hypothetical protein  28.22 
 
 
239 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4874  methyltransferase type 12  27.88 
 
 
255 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.983195  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4963  methyltransferase type 12  27.88 
 
 
255 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12009  hypothetical protein  26.72 
 
 
282 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5242  methyltransferase type 11  27.91 
 
 
255 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3807  methyltransferase type 12  20.68 
 
 
237 aa  59.7  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5469  methyltransferase type 11  28.83 
 
 
244 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1326  methyltransferase type 11  28.64 
 
 
243 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.517488 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10913  hypothetical protein  22.84 
 
 
236 aa  56.6  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127289  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2675  hypothetical protein  28.41 
 
 
253 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3186  Methyltransferase type 12  21.59 
 
 
245 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.458893  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5034  Methyltransferase type 12  22.27 
 
 
237 aa  53.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1686  SAM-dependent methyltransferase  23.44 
 
 
263 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0634865 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4741  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
305 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.168171 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04540  hypothetical protein  27.78 
 
 
237 aa  50.1  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1610  Methyltransferase type 11  36.25 
 
 
274 aa  49.3  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1341  hypothetical protein  23.45 
 
 
238 aa  48.5  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18910  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  29.12 
 
 
268 aa  48.9  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.07476  normal  0.315555 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2197  hypothetical protein  29.14 
 
 
243 aa  46.2  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  30.3 
 
 
2867 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  37.93 
 
 
277 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0419  hypothetical protein  19.74 
 
 
230 aa  43.5  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.271566 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0254  methyltransferase type 11  19.21 
 
 
230 aa  43.5  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.753586 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.84 
 
 
255 aa  43.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>