36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0772 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0772  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 310 aa  629  1e-179  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0508  methyltransferase type 12  58.53 
 
 		 316 aa  346  3e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.16741  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1982  Methyltransferase type 12  53.75 
 
 		 311 aa  338  9e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0266324  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0252  hypothetical protein  52.35 
 
 		 301 aa  320  9.999999999999999e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0502  Methyltransferase type 12  49.83 
 
 		 299 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.510695 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1673  hypothetical protein  45.54 
 
 		 312 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0465  methyltransferase type 12  46.15 
 
 		 320 aa  245  6.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.691055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1341  hypothetical protein  25.44 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4874  methyltransferase type 12  27.05 
 
 		 255 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.983195  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4963  methyltransferase type 12  27.05 
 
 		 255 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3807  methyltransferase type 12  22.57 
 
 		 237 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5242  methyltransferase type 11  27.05 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5469  methyltransferase type 11  28.19 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1326  methyltransferase type 11  28.51 
 
 		 243 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.517488 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3234  Methyltransferase type 11  25.81 
 
 		 235 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1026  Methyltransferase type 11  25.61 
 
 		 235 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1686  SAM-dependent methyltransferase  23.66 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0634865 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18910  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  30.33 
 
 		 268 aa  50.8  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.07476  normal  0.315555 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12009  hypothetical protein  26.43 
 
 		 282 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2728  SAM-dependent methyltransferase  22.1 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4741  methyltransferase type 11  24.88 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.168171 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18721  hypothetical protein  24.05 
 
 		 239 aa  46.2  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3186  Methyltransferase type 12  24.04 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.458893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2229  methyltransferase type 11  36.78 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1590  Methyltransferase type 11  34.88 
 
 		 279 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10913  hypothetical protein  23.05 
 
 		 236 aa  44.3  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127289  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2018  MCP methyltransferase, CheR-type  33.01 
 
 		 865 aa  44.3  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.854917  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1785  methyltransferase type 11  25.19 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0456688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0961  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 217 aa  43.9  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0435483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  28.92 
 
 		 280 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2092  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.05 
 
 		 270 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  33.71 
 
 		 273 aa  43.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  26.26 
 
 		 215 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0948  peptide release factor glutamine N(5)-methylase  29.03 
 
 		 301 aa  42.7  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4233  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 274 aa  42.7  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2287  methyltransferase type 11  29.05 
 
 		 282 aa  42.4  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108281  normal  0.170198 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>