34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4874 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4874  methyltransferase type 12  100 
 
 
255 aa  497  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.983195  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4963  methyltransferase type 12  100 
 
 
255 aa  497  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5242  methyltransferase type 11  98.82 
 
 
255 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5469  methyltransferase type 11  73.25 
 
 
244 aa  350  1e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1326  methyltransferase type 11  73.55 
 
 
243 aa  324  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.517488 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12009  hypothetical protein  54.66 
 
 
282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0252  hypothetical protein  29.82 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0508  methyltransferase type 12  32.42 
 
 
316 aa  69.3  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.16741  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0772  Methyltransferase type 12  27.52 
 
 
310 aa  63.5  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1982  Methyltransferase type 12  28.44 
 
 
311 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0266324  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
228 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0029  hypothetical protein  28.17 
 
 
273 aa  51.6  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3416  methyltransferase  26.02 
 
 
249 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1255  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 
154 aa  48.5  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  36.47 
 
 
272 aa  47.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  35.9 
 
 
196 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12280  predicted protein  22.53 
 
 
285 aa  46.6  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0372336  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1026  Methyltransferase type 11  29.69 
 
 
235 aa  46.6  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1262  type 11 methyltransferase  29.91 
 
 
273 aa  46.6  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.653357  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0180  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 
282 aa  45.8  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  30.45 
 
 
352 aa  45.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1197  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
223 aa  45.8  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.500309 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  24.81 
 
 
215 aa  45.4  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0502  Methyltransferase type 12  24.43 
 
 
299 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.510695 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3234  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 
235 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2354  methyltransferase type 11  29.13 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.202193  normal  0.578326 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0767  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 
194 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.763548  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6101  methyltransferase type 11  28.23 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372421  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0007  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  23.48 
 
 
250 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1338  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  23.48 
 
 
250 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0324  hypothetical protein  27.93 
 
 
258 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111917  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1085  methyltransferase type 12  35.9 
 
 
235 aa  42.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1137  transcriptional regulator  26.05 
 
 
395 aa  43.1  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000736319  hitchhiker  0.00587761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3130  hypothetical protein  34 
 
 
305 aa  42.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>