273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3416 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3416  methyltransferase  100 
 
 		 249 aa  513  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2223  methyltransferase type 11  57.08 
 
 		 293 aa  270  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128403  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4383  methyltransferase type 11  53.64 
 
 		 237 aa  244  6.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000226186 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3227  methyltransferase  45.68 
 
 		 254 aa  192  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1721  methyltransferase  40.91 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.501367 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2172  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.1 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.942434  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.66 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1591  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.1 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10291  methyltransferase  28.93 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.55915 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3665  Methyltransferase type 11  28.27 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  26.06 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  31.58 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66900  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.16 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7094  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.69 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000661752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.8 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4314  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  30.83 
 
 		 392 aa  55.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.97 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2700  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  28.78 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.19 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_4846  predicted protein  27.27 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.291862  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.19 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5469  methyltransferase type 11  27.82 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3735  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286886  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.56 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  25.14 
 
 		 271 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1236  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.46 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.228899  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0977  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.62 
 
 		 243 aa  53.1  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.270473 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1645  methyltransferase  25.11 
 
 		 209 aa  53.1  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3788  type 11 methyltransferase  26.7 
 
 		 306 aa  52.8  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.54 
 
 		 256 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  26.54 
 
 		 256 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  32.56 
 
 		 261 aa  52.4  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0387  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.54 
 
 		 256 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2205  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 		 362 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000273998 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5802  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.54 
 
 		 256 aa  52  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3751  Methyltransferase type 11  30.14 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0240  methyltransferase type 11  27.73 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.164188 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51145  predicted protein  29.32 
 
 		 363 aa  51.6  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 286 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1204  generic methyl-transferase  33.96 
 
 		 363 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2414  hypothetical protein  26.71 
 
 		 351 aa  50.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177274  normal  0.0190439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3622  methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.932817  normal  0.0502026 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1973  demethylmenaquinone methyltransferase  28.18 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  32.39 
 
 		 266 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  32.77 
 
 		 347 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  27.33 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3864  Methyltransferase type 11  24.64 
 
 		 305 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5061  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.31 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0103  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.94 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.881721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3913  Methyltransferase type 11  24.64 
 
 		 305 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.100491  normal  0.248183 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0454  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.31 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0799871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3328  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  30.64 
 
 		 210 aa  50.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5011  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.31 
 
 		 256 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0894  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.43 
 
 		 235 aa  49.7  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000138444  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4369  Methyltransferase type 11  27.98 
 
 		 315 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4885  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.31 
 
 		 256 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4431  Methyltransferase type 11  27.98 
 
 		 315 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.184386 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 219 aa  50.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 190 aa  49.7  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  25.85 
 
 		 207 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2723  Methyltransferase type 11  26.95 
 
 		 200 aa  49.7  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  25.85 
 
 		 207 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0149  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.25 
 
 		 351 aa  49.3  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1266  generic methyl-transferase  31.13 
 
 		 357 aa  49.3  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0714  methyltransferase  24.66 
 
 		 231 aa  49.3  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  33.33 
 
 		 272 aa  49.3  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.06 
 
 		 256 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3367  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.71 
 
 		 235 aa  49.3  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1262  type 11 methyltransferase  26.75 
 
 		 273 aa  48.9  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.653357  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4221  Methyltransferase type 11  28.33 
 
 		 220 aa  48.9  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3694  Methyltransferase type 11  29.06 
 
 		 285 aa  48.9  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00559242  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2158  methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 363 aa  48.5  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  30.58 
 
 		 269 aa  48.5  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  30.58 
 
 		 266 aa  48.5  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  28.46 
 
 		 168 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.51 
 
 		 280 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5242  methyltransferase type 11  26.54 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  26.85 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4009  type 11 methyltransferase  24.54 
 
 		 319 aa  48.5  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  30.56 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0698  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  24.29 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  30 
 
 		 526 aa  48.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  47.27 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12280  predicted protein  28.91 
 
 		 285 aa  47.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0372336  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10041  methyltransferase  24.29 
 
 		 351 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_4986  predicted protein  25.9 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.778509 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  24.58 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.17 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.29 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  29.5 
 
 		 206 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0353  methyltransferase type 12  31.13 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0874936 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  28.71 
 
 		 330 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  41.67 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>