More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12280 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_12280  predicted protein  100 
 
 
285 aa  593  1e-169  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0372336  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0180  Methyltransferase type 11  33.45 
 
 
282 aa  153  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  33.45 
 
 
559 aa  142  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17021  putative sarcosine-dimethylglycine methyltransferase  32.62 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.650309 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1677  methyltransferase type 11  30.53 
 
 
278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1180  methyltransferase type 11  31.47 
 
 
279 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  31.67 
 
 
286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  31.79 
 
 
279 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  28.33 
 
 
277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  28.62 
 
 
572 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  25.96 
 
 
280 aa  105  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10531  methyltransferase  40.82 
 
 
116 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  27.67 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  40.95 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  24.43 
 
 
278 aa  65.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  26.99 
 
 
271 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0083  Methyltransferase type 11  30.14 
 
 
250 aa  62.4  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  24.27 
 
 
282 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  33.53 
 
 
355 aa  59.7  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 
241 aa  59.7  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  31.14 
 
 
226 aa  59.3  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.19 
 
 
330 aa  58.9  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  25.51 
 
 
286 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.07 
 
 
205 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2180  putative methyltransferase  36.72 
 
 
239 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3215  methyltransferase type 11  31.29 
 
 
278 aa  56.6  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000307808 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  30.13 
 
 
284 aa  56.6  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.9 
 
 
201 aa  57  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  29.02 
 
 
328 aa  56.6  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  26.7 
 
 
342 aa  56.2  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
279 aa  56.2  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3585  methyltransferase type 11  28.81 
 
 
294 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.473605 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0991  methyltransferase type 11  35.09 
 
 
225 aa  55.8  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 
286 aa  55.5  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.66 
 
 
282 aa  55.5  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.85 
 
 
305 aa  55.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  39.05 
 
 
354 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  33.01 
 
 
211 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1836  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 
296 aa  55.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  30.69 
 
 
277 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  32.28 
 
 
270 aa  54.3  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  27.35 
 
 
248 aa  54.7  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.86 
 
 
291 aa  54.7  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  35.83 
 
 
291 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  29.35 
 
 
311 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 
365 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  32.46 
 
 
392 aa  53.9  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  31.9 
 
 
329 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  30.72 
 
 
246 aa  53.9  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  39.42 
 
 
225 aa  53.9  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1411  Methyltransferase type 11  33.03 
 
 
292 aa  53.5  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.456001  normal  0.135358 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  29.94 
 
 
267 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4388  methyltransferase type 11  23.78 
 
 
267 aa  53.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0989044  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  28.66 
 
 
226 aa  53.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 
210 aa  53.1  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2109  methyltransferase type 11  33.02 
 
 
296 aa  53.1  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.709004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  27.85 
 
 
331 aa  52.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0085  Methyltransferase type 11  24.49 
 
 
236 aa  52.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  33.83 
 
 
265 aa  52.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  27.98 
 
 
265 aa  52.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  27.61 
 
 
226 aa  52.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2147  methyltransferase type 11  22.17 
 
 
283 aa  52.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  28.05 
 
 
288 aa  52.4  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2205  Methyltransferase type 11  25.56 
 
 
362 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000273998 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  34.15 
 
 
229 aa  52.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2995  Methyltransferase type 11  26.21 
 
 
363 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  26.34 
 
 
309 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.71 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.64 
 
 
232 aa  52  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  27.22 
 
 
266 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  29.65 
 
 
341 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30710  predicted protein  27.54 
 
 
365 aa  51.6  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.38 
 
 
283 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 
269 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
187 aa  52  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  34.55 
 
 
349 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2451  Methyltransferase type 11  25.12 
 
 
267 aa  51.6  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
269 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
328 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
332 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  29.25 
 
 
274 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
328 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  28.11 
 
 
311 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
328 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0320  hypothetical protein  27.97 
 
 
290 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0254  methyltransferase type 12  28.81 
 
 
290 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  28.96 
 
 
310 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  31.72 
 
 
226 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1190  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.3 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  26.22 
 
 
310 aa  50.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  28.39 
 
 
328 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  29.09 
 
 
331 aa  51.2  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1546  NodS  31.16 
 
 
283 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377082  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0725  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 
313 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  31.19 
 
 
327 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16375  predicted protein  30.21 
 
 
279 aa  51.2  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00657234  normal  0.224356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  30 
 
 
341 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 
239 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  26.35 
 
 
275 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>