More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4893 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  100 
 
 		 274 aa  550  1e-156  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  80.15 
 
 		 277 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  49.81 
 
 		 276 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  44.87 
 
 		 286 aa  207  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  43.73 
 
 		 284 aa  203  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3215  methyltransferase type 11  40.61 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000307808 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.29 
 
 		 273 aa  189  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0668  Methyltransferase type 11  42.05 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0172  methyltransferase type 11  41.18 
 
 		 275 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2958  hypothetical protein  33.72 
 
 		 278 aa  165  8e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  35.75 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  37.65 
 
 		 382 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  30.24 
 
 		 271 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 279 aa  87.8  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 286 aa  87  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  31.79 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 		 261 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  32.16 
 
 		 776 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  30.58 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1480  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.9 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.731828  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0069  phosphoethanolamine N-methyltransferase  30.9 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0516193  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1568  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.9 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42420  predicted protein  30.05 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.679564 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  33.12 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  26.4 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30710  predicted protein  25.33 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  26.19 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  35.66 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  36.13 
 
 		 392 aa  72.4  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  33.52 
 
 		 281 aa  72  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.65 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.15 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  19.91 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  33.65 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  26.2 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  30.9 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3261  SAM-dependent methyltransferase  25.94 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  25.42 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2451  Methyltransferase type 11  34.85 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  35.94 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  30.06 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  39.2 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  31.93 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  36.14 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1677  methyltransferase type 11  28.34 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.49 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 1012 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  31.18 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16375  predicted protein  28.16 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00657234  normal  0.224356 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  35.58 
 
 		 310 aa  65.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  26.11 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  34.57 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  29.6 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  35.62 
 
 		 246 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  35.96 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  34.19 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  32.74 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  35.58 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19461  SAM-binding motif-containing protein  34.19 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10824  predicted protein  30.23 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0540311  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0440629 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  35.9 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.29 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  36.52 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0271  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.14 
 
 		 413 aa  63.2  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.419642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  28.8 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  35.59 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0180  Methyltransferase type 11  29.68 
 
 		 282 aa  62  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  31.61 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  34.17 
 
 		 559 aa  62.4  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.54 
 
 		 283 aa  62  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  25.39 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.46 
 
 		 247 aa  62  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.120652  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  33.03 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  37.74 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.4 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.48 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2897  Methyltransferase type 11  27.56 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5061  Methyltransferase type 11  37.17 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1836  Methyltransferase type 11  27.83 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  35.58 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0101  Methyltransferase type 11  36.22 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0685  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.07 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.132671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  38.61 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  23.08 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>