More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2958 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2958  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  573  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  39.26 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.95 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3215  methyltransferase type 11  35.69 
 
 		 278 aa  185  6e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000307808 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0668  Methyltransferase type 11  37.83 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  33.7 
 
 		 284 aa  169  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 277 aa  168  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  33.21 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  33.72 
 
 		 274 aa  165  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0172  methyltransferase type 11  35.53 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  29.72 
 
 		 559 aa  95.9  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  32.72 
 
 		 275 aa  86.7  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10824  predicted protein  39.13 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0540311  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2451  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1180  methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  33.83 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  32.46 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  36.21 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  27.42 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2147  methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  27.13 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42420  predicted protein  34.07 
 
 		 317 aa  75.5  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.679564 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  28.07 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  27.38 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.64 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  28.06 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30710  predicted protein  27.11 
 
 		 365 aa  73.2  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  28.45 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  28.04 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  27.98 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  35.88 
 
 		 634 aa  72.4  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  25.27 
 
 		 286 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0223  SAM-dependent methyltransferase  28.93 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  34.43 
 
 		 1012 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  35.78 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  35.78 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 572 aa  69.3  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.47 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1677  methyltransferase type 11  22.77 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  34.51 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  34.16 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  37.11 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  27.68 
 
 		 278 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.15 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.96 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  23.76 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0180  Methyltransferase type 11  20.19 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  26.99 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  36.08 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.71 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.74 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  32.92 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.82 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  38.79 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.04 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  27.4 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  27.38 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  30.63 
 
 		 347 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  27.45 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  27.45 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  30.36 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.86 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1625  hypothetical protein  23.2 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.207342 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  32.74 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  28.31 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3400  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.74 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.53 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  25 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  25.93 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  33.62 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17021  putative sarcosine-dimethylglycine methyltransferase  27.87 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.650309 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  26.74 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  24.55 
 
 		 776 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  32.74 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  30.97 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.69 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  31.36 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  25.77 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  34.45 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 		 710 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  27.33 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3261  SAM-dependent methyltransferase  32.08 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0984  methyltransferase type 11  33.67 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16375  predicted protein  26.99 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00657234  normal  0.224356 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>