More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0604 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  100 
 
 		 276 aa  559  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  43.24 
 
 		 282 aa  180  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  42.79 
 
 		 279 aa  175  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 278 aa  175  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  39.23 
 
 		 287 aa  169  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  44.16 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  39.25 
 
 		 271 aa  149  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  41.06 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  38.94 
 
 		 275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  36.74 
 
 		 284 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  35.41 
 
 		 382 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2147  methyltransferase type 11  31.56 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.86 
 
 		 280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.76 
 
 		 305 aa  109  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  30.42 
 
 		 264 aa  105  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  29.77 
 
 		 286 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3261  SAM-dependent methyltransferase  32.2 
 
 		 287 aa  102  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234445  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  30.69 
 
 		 280 aa  99.8  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  28.5 
 
 		 283 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 283 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  34.27 
 
 		 304 aa  95.5  8e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  36.02 
 
 		 328 aa  92.8  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  36.59 
 
 		 328 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  31.11 
 
 		 311 aa  92  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.9 
 
 		 282 aa  91.3  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  32.28 
 
 		 318 aa  90.9  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  34.13 
 
 		 392 aa  89.7  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  25.37 
 
 		 277 aa  89.4  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4388  methyltransferase type 11  30 
 
 		 267 aa  89  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0989044  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  28.1 
 
 		 279 aa  89.4  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  29.02 
 
 		 270 aa  89.4  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 572 aa  89  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  30.56 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  30.3 
 
 		 559 aa  86.7  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.54 
 
 		 330 aa  87  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 286 aa  86.7  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  30.77 
 
 		 306 aa  86.3  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  30.13 
 
 		 342 aa  86.3  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  33.14 
 
 		 1012 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  29.67 
 
 		 377 aa  85.5  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  32.64 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  31.11 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  30.22 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  36.59 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.05 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2451  Methyltransferase type 11  32.56 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2025  sterol-C-methyltransferase  33.15 
 
 		 310 aa  82  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  39.45 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  30.77 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  25.46 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  29.59 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  37.9 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19461  SAM-binding motif-containing protein  28.99 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  37.1 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10269  predicted protein  30.49 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17021  putative sarcosine-dimethylglycine methyltransferase  27.12 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.650309 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10824  predicted protein  29.21 
 
 		 304 aa  75.5  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0540311  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.27 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  31.09 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1677  methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0601  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  29.19 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  27.88 
 
 		 343 aa  72.4  0.000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  38.61 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1353  Methyltransferase type 11  30.26 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0337053  hitchhiker  0.000000492717 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  31.76 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30710  predicted protein  29.73 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0323  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  34.46 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  30.58 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2958  hypothetical protein  34.82 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  30.58 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0746  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.11 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  31.18 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  36.75 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0725  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 313 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1411  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.456001  normal  0.135358 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0668  Methyltransferase type 11  32.81 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42420  predicted protein  24.87 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.679564 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  30.52 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1180  methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  38.74 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  29.87 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.46 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2109  methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.709004  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1836  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1326  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.97 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  31.75 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.79 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  36.57 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0172  methyltransferase type 11  39.5 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3068  Methyltransferase type 12  32.43 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1057  Methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.783467  hitchhiker  0.00010073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0387  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.76 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>