More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0317 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  100 
 
 
304 aa  619  1e-176  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2025  sterol-C-methyltransferase  78.88 
 
 
310 aa  502  1e-141  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  72.67 
 
 
304 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  64.21 
 
 
309 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  60.55 
 
 
310 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  60.07 
 
 
311 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  59.66 
 
 
311 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  58.89 
 
 
310 aa  368  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  59.03 
 
 
311 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19461  SAM-binding motif-containing protein  58.89 
 
 
310 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  59.59 
 
 
310 aa  362  4e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  55.1 
 
 
328 aa  359  3e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  57.73 
 
 
330 aa  355  7.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  54.58 
 
 
328 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  38.41 
 
 
392 aa  218  7.999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  40.4 
 
 
306 aa  207  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10269  predicted protein  39.06 
 
 
295 aa  189  5e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  34.74 
 
 
318 aa  168  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
293 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 
284 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  32.99 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  36.56 
 
 
382 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  32.08 
 
 
342 aa  145  6e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  31.94 
 
 
283 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 
283 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  32.29 
 
 
280 aa  142  9e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.16 
 
 
280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  38.98 
 
 
274 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  37.99 
 
 
271 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  31.67 
 
 
295 aa  102  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  34.93 
 
 
261 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  32.16 
 
 
278 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  31.73 
 
 
282 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  33.33 
 
 
377 aa  94.4  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.32 
 
 
282 aa  94.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  34.29 
 
 
279 aa  94.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  32.98 
 
 
343 aa  93.6  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  33.15 
 
 
276 aa  92.4  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  35.47 
 
 
275 aa  91.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.43 
 
 
305 aa  90.5  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3261  SAM-dependent methyltransferase  34.46 
 
 
287 aa  87.4  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234445  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10824  predicted protein  31.68 
 
 
304 aa  86.7  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0540311  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  43.41 
 
 
273 aa  85.1  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  29.6 
 
 
295 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  33.17 
 
 
286 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  26.94 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  30.5 
 
 
572 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30710  predicted protein  30.29 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  39.83 
 
 
276 aa  79  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  30.6 
 
 
559 aa  76.3  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  27.67 
 
 
377 aa  75.9  0.0000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17021  putative sarcosine-dimethylglycine methyltransferase  33.13 
 
 
282 aa  75.9  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.650309 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1353  Methyltransferase type 11  35 
 
 
280 aa  75.5  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0337053  hitchhiker  0.000000492717 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0668  Methyltransferase type 11  44.04 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  32.4 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  42.34 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42420  predicted protein  30.91 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.679564 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  32.95 
 
 
776 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  34.62 
 
 
347 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  33.12 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  41.53 
 
 
277 aa  73.6  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1026  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 
264 aa  72  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.5 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1180  methyltransferase type 11  31.87 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  28.05 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2411  methyltransferase type 11  33.78 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2451  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  38.52 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  38.52 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  36.45 
 
 
281 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  38.52 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1677  methyltransferase type 11  30.59 
 
 
278 aa  68.9  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0006  hypothetical protein  35.17 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.868865  normal  0.0557095 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  31.18 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0180  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1115  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  27.17 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.9654 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1527  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.45 
 
 
394 aa  65.9  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1559  hypothetical protein  37.86 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00538046  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2649  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.38 
 
 
415 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0578562  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.48 
 
 
213 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  38.53 
 
 
261 aa  64.3  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
276 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1309  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.18 
 
 
423 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2646  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 
248 aa  63.5  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 
208 aa  63.5  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  32.65 
 
 
634 aa  63.5  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  30.88 
 
 
244 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
258 aa  63.5  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2229  methyltransferase type 11  30.63 
 
 
276 aa  63.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  40.74 
 
 
286 aa  63.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0234  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  39.5 
 
 
420 aa  63.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.950577 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  30.22 
 
 
265 aa  62.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1683  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 
287 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.430407  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4629  Methyltransferase type 11  35.07 
 
 
270 aa  62.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5080  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.37 
 
 
395 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0064  Methyltransferase type 11  39.06 
 
 
247 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5415  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.34 
 
 
394 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.424397 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3033  thioesterase  37.3 
 
 
829 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.862159  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2741  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  35.48 
 
 
400 aa  62.4  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>