More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4431 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  100 
 
 
295 aa  599  1e-170  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  80.68 
 
 
295 aa  495  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  43.32 
 
 
282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1559  hypothetical protein  44.34 
 
 
208 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00538046  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2109  methyltransferase type 11  40.83 
 
 
296 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.709004  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2411  methyltransferase type 11  34.85 
 
 
263 aa  116  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1836  Methyltransferase type 11  39.05 
 
 
296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  35.19 
 
 
274 aa  112  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0725  Methyltransferase type 11  39.64 
 
 
313 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  33.91 
 
 
382 aa  105  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  40.27 
 
 
271 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1411  Methyltransferase type 11  37.18 
 
 
292 aa  103  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.456001  normal  0.135358 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  31.67 
 
 
304 aa  102  6e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
293 aa  102  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  39.87 
 
 
261 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  40.94 
 
 
279 aa  98.2  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  30.4 
 
 
304 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  29.13 
 
 
310 aa  97.4  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1057  Methyltransferase type 11  36.54 
 
 
292 aa  97.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.783467  hitchhiker  0.00010073 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  35.26 
 
 
278 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  37.18 
 
 
282 aa  96.3  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3261  SAM-dependent methyltransferase  35.17 
 
 
287 aa  96.3  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234445  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  36.54 
 
 
284 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2025  sterol-C-methyltransferase  36.42 
 
 
310 aa  94.7  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  30.06 
 
 
306 aa  94.7  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  26.86 
 
 
286 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  33.77 
 
 
311 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  32.45 
 
 
328 aa  94  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  33.77 
 
 
310 aa  92.4  9e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  31.35 
 
 
310 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  31.79 
 
 
328 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  31.35 
 
 
311 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  25.74 
 
 
283 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  26.16 
 
 
283 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.04 
 
 
280 aa  90.1  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  26.81 
 
 
280 aa  90.1  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19461  SAM-binding motif-containing protein  32.28 
 
 
310 aa  89.7  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  39.47 
 
 
281 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  29.51 
 
 
309 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  31.02 
 
 
311 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.89 
 
 
330 aa  86.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  27.83 
 
 
342 aa  86.3  6e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  37.42 
 
 
287 aa  86.3  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  29.01 
 
 
392 aa  84.7  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  34.62 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  30.13 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 
273 aa  81.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.93 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2147  methyltransferase type 11  29.86 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  35.44 
 
 
347 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12966  methyltransferase  41.59 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0984  methyltransferase type 11  36.31 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  37.07 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0140  methyltransferase  38.18 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07721  methyltransferase  37.38 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0608577 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  38.76 
 
 
832 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  36.59 
 
 
276 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10269  predicted protein  27.65 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  36.13 
 
 
377 aa  74.3  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  27.81 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  38.53 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  31.78 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  33.33 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  31.1 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  35.71 
 
 
387 aa  72.4  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  45 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  37.39 
 
 
276 aa  72.4  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  34.43 
 
 
415 aa  72.4  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1113  methyltransferase type 11  39.05 
 
 
319 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629842  normal  0.748747 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.74 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
202 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  39.13 
 
 
241 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16301  methyltransferase  39.25 
 
 
357 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.346442 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.5 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  35.96 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  33.96 
 
 
204 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  34.96 
 
 
168 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.43 
 
 
279 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  33.96 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  33.96 
 
 
204 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0228  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 
276 aa  70.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  35.29 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2958  hypothetical protein  35.78 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.96 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  37.17 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  38.85 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1652  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.34 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.583368 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.19 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10824  predicted protein  30.09 
 
 
304 aa  69.7  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0540311  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  35.04 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  38.18 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  35.04 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  35.04 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  34.68 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  32.93 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  33.59 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  36.48 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>