More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0228 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0228  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 276 aa  536  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4710  Methyltransferase type 11  42.8 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  30.32 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  40.26 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 328 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  37.34 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  33.54 
 
 		 347 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  36.71 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1113  methyltransferase type 11  39.68 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629842  normal  0.748747 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1411  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.456001  normal  0.135358 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  38.24 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  32.69 
 
 		 310 aa  72  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  34.1 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.17 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  42.16 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  25.98 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  36.05 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  28.22 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  38.33 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  32.85 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4218  methyltransferase type 11  41.18 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  30.14 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1836  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.61 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  36.65 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2109  methyltransferase type 11  25.48 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.709004  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  37.5 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  43.51 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 382 aa  65.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  35.77 
 
 		 832 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2025  sterol-C-methyltransferase  32.5 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  27.32 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3246  Methyltransferase type 11  37.95 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00392072  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0984  methyltransferase type 11  31.94 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12966  methyltransferase  31.37 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  33.03 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  39.13 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  32.19 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1057  Methyltransferase type 11  26.39 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.783467  hitchhiker  0.00010073 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  28.48 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  33.51 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  27.22 
 
 		 392 aa  62.4  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0725  Methyltransferase type 11  26.52 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  35.29 
 
 		 309 aa  62  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  40.21 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  32.4 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  34.81 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.34 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0997  methyltransferase type 11  24.52 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.698305 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19461  SAM-binding motif-containing protein  38.26 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.08 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  34.62 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  31.73 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.8 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  35.22 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  26.58 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  33.78 
 
 		 417 aa  59.3  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  29.35 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  35.22 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10824  predicted protein  29.86 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0540311  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  37.09 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_345  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.37 
 
 		 200 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  30.67 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  39 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  29.35 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  35.22 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  30.77 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.25 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  26.49 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  32.24 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  33.12 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  35.77 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  35.35 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10269  predicted protein  33.33 
 
 		 295 aa  57  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  32.92 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  35.64 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  27.14 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  35.2 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  36.54 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.62 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3308  demethylmenaquinone methyltransferase  34.4 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.717606 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  29.41 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0381  methyltransferase type 11  26.95 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0402  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.66 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  31.14 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.64 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_002950  PG1467  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.23 
 
 		 203 aa  55.1  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0981  methyltransferase type 11  42.06 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>