More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4218 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4218  methyltransferase type 11  100 
 
 		 261 aa  525  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  38.85 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 248 aa  89.4  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  40 
 
 		 263 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  38.13 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  38.41 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  37.31 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  39.55 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1869  methyltransferase type 11  41.04 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235933  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1915  methyltransferase type 11  41.04 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.107391  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  34.44 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  31.11 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 		 1106 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  35.57 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  38.39 
 
 		 255 aa  72  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  34.25 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 		 1032 aa  68.9  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  36.73 
 
 		 305 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0228  Methyltransferase type 11  42.16 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2109  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.709004  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  39.6 
 
 		 347 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1836  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  41.05 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0725  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  27.83 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1113  methyltransferase type 11  43 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629842  normal  0.748747 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  40 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  27.83 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  32.28 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1559  hypothetical protein  37.25 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00538046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  22.55 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  40.2 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  35.35 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  26.96 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  33.63 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 222 aa  62  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  26.96 
 
 		 236 aa  62  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  27.92 
 
 		 226 aa  62  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  34.86 
 
 		 295 aa  62  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  26.09 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  26.09 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  26.96 
 
 		 209 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  26.96 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  26.96 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  26.09 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  29.73 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  27.33 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4832  methyltransferase type 11  31.76 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0147  Methyltransferase type 11  40.54 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3334  methyltransferase type 11  31.76 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  29.93 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  34.26 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4181  methyltransferase type 11  31.76 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  28.44 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3246  Methyltransferase type 11  38.54 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00392072  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  29.58 
 
 		 634 aa  59.3  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1616  hypothetical protein  32.71 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5881  methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0742  type 11 methyltransferase  37.07 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.166057 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  34.46 
 
 		 362 aa  58.9  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.52 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  25.55 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  28.86 
 
 		 263 aa  58.5  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1057  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.783467  hitchhiker  0.00010073 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0312  Methyltransferase type 11  41 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  29.31 
 
 		 558 aa  58.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  36.81 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2739  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  37.86 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  25 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  32.69 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.08 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  24.82 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  29.44 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  31.37 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6134  methyltransferase type 11  33.55 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145601  normal  0.0218248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2360  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.175254  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  34.75 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6644  methyltransferase type 11  37.08 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12966  methyltransferase  37.11 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  31.85 
 
 		 330 aa  57  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 210 aa  57  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>