More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1068 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  100 
 
 
417 aa  842    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30.14 
 
 
225 aa  79  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  40.57 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  34.1 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.06 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  38.18 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  31.87 
 
 
239 aa  70.1  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.31 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  30.05 
 
 
246 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.14 
 
 
230 aa  69.3  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 
255 aa  69.3  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  26.85 
 
 
311 aa  69.7  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6348  hypothetical protein  30.11 
 
 
394 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  40.17 
 
 
237 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73140  hypothetical protein  32.61 
 
 
394 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1028  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  33.53 
 
 
237 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  35.34 
 
 
240 aa  65.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2594  Methyltransferase type 11  35.77 
 
 
262 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  32.37 
 
 
225 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  40.74 
 
 
261 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 
232 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1779  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 
212 aa  65.1  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3819  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.67 
 
 
248 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 
232 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.95 
 
 
232 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 
232 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  35.46 
 
 
236 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0736  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.61 
 
 
232 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421351  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.78 
 
 
259 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 
230 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
283 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  24.84 
 
 
286 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.43 
 
 
345 aa  63.9  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  38.17 
 
 
258 aa  64.3  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  32.79 
 
 
263 aa  64.3  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  35.09 
 
 
281 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.19 
 
 
252 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204476  normal  0.816598 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1966  Methyltransferase type 11  27.6 
 
 
264 aa  63.9  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3190  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.72 
 
 
421 aa  63.5  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0299  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiT subunit  30.67 
 
 
189 aa  63.5  0.000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.56429  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  27.8 
 
 
225 aa  63.5  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  38.74 
 
 
261 aa  63.5  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  30.17 
 
 
279 aa  63.5  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  30.81 
 
 
292 aa  63.2  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2539  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
237 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1395  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.61 
 
 
430 aa  62.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196126  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
283 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  35.82 
 
 
239 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  32.06 
 
 
257 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  28.02 
 
 
228 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4563  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.77 
 
 
394 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.22 
 
 
239 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 
259 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.86 
 
 
215 aa  61.6  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.95 
 
 
232 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1175  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.14 
 
 
247 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.125464  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  34.62 
 
 
233 aa  62  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  29.78 
 
 
382 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00659  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- benzoquinol methylase  27.54 
 
 
250 aa  62  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0386  methyltransferase  33.33 
 
 
225 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  30.13 
 
 
282 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5666  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.91 
 
 
395 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228934  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  30.66 
 
 
283 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  34.55 
 
 
259 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04480  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.9 
 
 
263 aa  60.8  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.110079  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 
261 aa  60.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.44 
 
 
236 aa  60.8  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
257 aa  60.8  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
254 aa  60.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  28.04 
 
 
310 aa  60.8  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.05 
 
 
247 aa  60.8  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  32.93 
 
 
237 aa  60.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  30.36 
 
 
341 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.78 
 
 
234 aa  60.5  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  39.47 
 
 
233 aa  60.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  25.56 
 
 
283 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3473  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.67 
 
 
415 aa  60.5  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.449759 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 
276 aa  60.1  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0981  methyltransferase type 11  39.42 
 
 
229 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  37.9 
 
 
253 aa  60.1  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.59 
 
 
254 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.54 
 
 
247 aa  60.1  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  29.7 
 
 
332 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
256 aa  60.1  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.86 
 
 
234 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.43 
 
 
232 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  31.86 
 
 
243 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
256 aa  60.1  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6084  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  29.17 
 
 
229 aa  59.7  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  31.86 
 
 
243 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  32.85 
 
 
272 aa  60.1  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  31.86 
 
 
243 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  30.68 
 
 
265 aa  60.1  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3308  demethylmenaquinone methyltransferase  30.64 
 
 
256 aa  59.7  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.717606 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2417  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.53 
 
 
414 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  29.23 
 
 
295 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.65 
 
 
229 aa  59.3  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>