More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6084 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6084  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  100 
 
 		 229 aa  470  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0085  Methyltransferase type 11  34.27 
 
 		 236 aa  121  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0855  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 		 240 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  26.17 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.69 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0477  Methyltransferase type 11  33.62 
 
 		 235 aa  62  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.59 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.59 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.19 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 417 aa  59.7  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.81 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.81 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.81 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.81 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.08 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3308  demethylmenaquinone methyltransferase  30.47 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.717606 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.4 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.23 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.08 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.13 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15760  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.08 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.64 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7427  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.84 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0427142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.13 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.71 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1113  bifunctional 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase and 2-octaprenyl-6-hydroxy phenol methylase  32.77 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.19 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2861  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.13 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0308666  decreased coverage  0.000000000135895 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.58 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  29.24 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  30.11 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.49 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  29.22 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.49 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  23.56 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.06 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.19 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2150  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.4 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.73 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  28.8 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.03 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 209 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  27.98 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  28.57 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  34.26 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1603  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.63 
 
 		 251 aa  53.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.905646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 259 aa  53.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.23 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5653  methyltransferase type 11  26.74 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6509  methyltransferase type 11  26.74 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6018  methyltransferase type 11  26.74 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.153765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0736  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.08 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.48 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 218 aa  53.1  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.35235  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.25 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  36.19 
 
 		 197 aa  53.1  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.64 
 
 		 234 aa  52.4  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  25.64 
 
 		 286 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  35.54 
 
 		 232 aa  52.8  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 581 aa  52.8  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 236 aa  52.8  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 257 aa  52.4  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  28.57 
 
 		 312 aa  52.4  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  29.13 
 
 		 233 aa  52.4  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  28.37 
 
 		 253 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.78 
 
 		 229 aa  52.4  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.25 
 
 		 234 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 260 aa  52  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  31.5 
 
 		 210 aa  52.4  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.2 
 
 		 241 aa  52  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.2 
 
 		 241 aa  52  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  34.55 
 
 		 232 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1162  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.78 
 
 		 238 aa  52  0.000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0717  Methyltransferase type 12  31.61 
 
 		 238 aa  52  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 274 aa  52  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0377  demethylmenaquinone methyltransferase  28.35 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370247  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  36.73 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  38.05 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  31.78 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.3 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.13 
 
 		 257 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0373  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1679  methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.81 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00359705  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6134  methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145601  normal  0.0218248 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.41 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0705  Methyltransferase type 11  23.37 
 
 		 300 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>