More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0287 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  100 
 
 
292 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6131  UbiE Methyltransferase type 11  44.48 
 
 
289 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1490  Methyltransferase type 11  42.01 
 
 
288 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000818174 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5370  Methyltransferase type 11  42.56 
 
 
288 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.328033 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3322  methyltransferase type 12  43.25 
 
 
318 aa  224  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.595734  normal  0.302163 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  35.14 
 
 
311 aa  157  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6137  methyltransferase UbiE  33.22 
 
 
290 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  28.63 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  30.56 
 
 
244 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
276 aa  109  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5629  Methyltransferase type 12  31.22 
 
 
263 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1301  Generic methyltransferase  33.33 
 
 
248 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2948  hypothetical protein  33.33 
 
 
248 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2259  Generic methyltransferase  33.83 
 
 
248 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3074  hypothetical protein  33.33 
 
 
248 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404761  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2382  generic methyltransferase  31.55 
 
 
243 aa  97.4  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680927  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
242 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  35.54 
 
 
233 aa  92.4  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  27.31 
 
 
251 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  28.75 
 
 
240 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4625  hypothetical protein  28.75 
 
 
237 aa  89.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394037  normal  0.982559 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4275  methyltransferase type 11  27.2 
 
 
251 aa  89.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1408  hypothetical protein  27.91 
 
 
237 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3306  Methyltransferase type 11  27.56 
 
 
249 aa  85.9  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1368  hypothetical protein  28.57 
 
 
237 aa  85.9  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1461  hypothetical protein  27.92 
 
 
237 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321475  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1003  hypothetical protein  27.92 
 
 
237 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1485  hypothetical protein  27.92 
 
 
237 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38639  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1380  hypothetical protein  27.08 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0942  Methyltransferase type 11  27.31 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000927283 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2234  Methyltransferase type 11  26.87 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  hitchhiker  0.000669188 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1376  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.331989 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  24.39 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  30.81 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  29.33 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  29.33 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  29.33 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3855  Methyltransferase type 12  26.8 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2661  hypothetical protein  26.42 
 
 
261 aa  70.1  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.588792  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 
268 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  35.33 
 
 
255 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 
268 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  32.89 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3939  Methyltransferase type 12  25.69 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136325 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  38.2 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1057  putative pristinamycin I synthase 3  26.52 
 
 
243 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00377731 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  34.58 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  24.34 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  29.59 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1390  SAM-binding motif-containing protein  31.79 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.671564 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3719  methyltransferase type 12  29.41 
 
 
211 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000247431  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5899  Methyltransferase type 11  34.83 
 
 
230 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.331708  normal  0.516672 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  29.53 
 
 
243 aa  64.7  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  25.75 
 
 
241 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1484  glycosyl transferase WecB/TagA/CpsF  29.41 
 
 
574 aa  63.9  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000853936  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  28 
 
 
237 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  30.81 
 
 
417 aa  63.2  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  37.07 
 
 
249 aa  63.2  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  26.95 
 
 
369 aa  63.2  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 
711 aa  62.8  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  24.88 
 
 
276 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  29.56 
 
 
293 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
710 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  27.86 
 
 
213 aa  60.8  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  28.14 
 
 
196 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1349  methyltransferase type 11  28.67 
 
 
581 aa  60.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00108025  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  36 
 
 
263 aa  60.5  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  36 
 
 
263 aa  60.5  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  36 
 
 
263 aa  60.5  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  25.69 
 
 
457 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 
248 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  38.46 
 
 
237 aa  60.5  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0533  type 12 methyltransferase  25.56 
 
 
260 aa  59.7  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324241  decreased coverage  0.00341349 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  33.03 
 
 
265 aa  59.7  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  28.73 
 
 
293 aa  59.7  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  29.03 
 
 
238 aa  59.3  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  30.46 
 
 
237 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 
457 aa  59.3  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1616  hypothetical protein  28.57 
 
 
238 aa  59.3  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  25 
 
 
259 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  31.33 
 
 
243 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3603  Methyltransferase type 11  27.33 
 
 
269 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473766 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  22.22 
 
 
248 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  28.1 
 
 
291 aa  58.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2962  methyltransferase type 11  23.88 
 
 
401 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  29.37 
 
 
400 aa  57.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2486  23S rRNA methyltransferase A  25 
 
 
268 aa  58.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.228527  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1112  methyltransferase type 11  27.17 
 
 
246 aa  57.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0760451  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4536  methyltransferase type 12  28.67 
 
 
237 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2660  23S rRNA methyltransferase A  25.89 
 
 
271 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000543045  hitchhiker  0.00521689 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1757  methylase  24.77 
 
 
240 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  29.01 
 
 
281 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1427  methyltransferase type 12  26.14 
 
 
251 aa  57  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  35 
 
 
239 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  30.33 
 
 
283 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  29.49 
 
 
289 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1747  23S rRNA methyltransferase A  25.89 
 
 
271 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00290496  normal  0.326236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>