More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1028 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1028  methyltransferase type 11  100 
 
 		 250 aa  506  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  78.78 
 
 		 248 aa  395  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  33.8 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4216  methyltransferase type 11  33.82 
 
 		 277 aa  98.6  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  37.67 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  42.48 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08181  hypothetical protein  32.2 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.56465  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  41.59 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  40.71 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.53 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  39.83 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  41.44 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  42.42 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  44.25 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  41.13 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  37.3 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.92 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  42.72 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  45.1 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  44.44 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1460  methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.60854  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  45.1 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  45.1 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  45.1 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  42.59 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2490  Methyltransferase type 11  32.55 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4421  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.94 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.28 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.28 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.13 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  39.13 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  33.79 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.13 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.7 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.13 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  36.51 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  32.88 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  37.9 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  37.37 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  44.12 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40.28 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.355376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4023  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.86 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  37.59 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  39.81 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.84 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  37.84 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.56 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  38.83 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.98 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  35.48 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.98 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.98 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.98 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.56 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  32.88 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 274 aa  65.1  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.98 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  35.43 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  36.59 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.93 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2605  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.06 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0775549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2016  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.81 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.47 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  39.6 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  36.28 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7094  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.97 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000661752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  34.96 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  34.06 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  35.59 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  36.09 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  35.59 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  36.8 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.54 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0350  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  35.59 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1317  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.61 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  37.27 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2402  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.06 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.21 
 
 		 232 aa  62  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  38.61 
 
 		 256 aa  62  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  31.37 
 
 		 253 aa  62  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  28.5 
 
 		 286 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  31.37 
 
 		 253 aa  62  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2418  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.224648 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.29 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  32.77 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.59 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1044  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.59 
 
 		 232 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3440  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>