More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0350 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0350  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 253 aa  526  1e-148  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0585  methyltransferase type 11  66.8 
 
 		 253 aa  365  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  40.49 
 
 		 249 aa  194  9e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3419  methyltransferase type 11  36.96 
 
 		 261 aa  179  4.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381882 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1685  hypothetical protein  33.74 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1584  methyltransferase type 11  36.21 
 
 		 250 aa  165  5e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2976  hypothetical protein  36.48 
 
 		 250 aa  162  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3977  normal  0.29484 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1825  methyltransferase type 11  32.24 
 
 		 254 aa  162  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.627869  normal  0.366066 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04067  SAM-dependent methyltransferase  36.36 
 
 		 390 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8125  acetyltransferase-like protein  38.17 
 
 		 464 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0966  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 392 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0250  MerR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 392 aa  152  7e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.757542 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4877  methyltransferase type 11  35.66 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1585  hypothetical protein  34.68 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1437  MerR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 390 aa  149  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0767  MerR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 390 aa  149  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0064  Methyltransferase type 11  34.03 
 
 		 249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262124  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1075  hypothetical protein  31.28 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.238827  normal  0.291334 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0938  MerR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 398 aa  143  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 247 aa  139  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 391 aa  132  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7265  MerR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 391 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2073  methyltransferase type 12  32.37 
 
 		 239 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.131474  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2724  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.05 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1382  methyltransferase type 12  31.4 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00680014  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1961  methyltransferase type 12  26.02 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00015321  normal  0.48171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.47 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  35.14 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.52 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  25 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 286 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.83 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.88 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.45 
 
 		 244 aa  67  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0767  hypothetical protein  38.32 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0255585  normal  0.0371895 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  31.25 
 
 		 559 aa  64.7  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  26.39 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  23.36 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.92 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.07 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  31.09 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5813  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  25.23 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1028  methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0468  hypothetical protein  27.78 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 209 aa  62  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  31.25 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.54 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.41 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  29.6 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  29.91 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.51 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.03 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0485  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.51 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.693247  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4388  methyltransferase type 11  23.92 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0989044  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2762  Methyltransferase type 11  29.92 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  27.27 
 
 		 776 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  32.04 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.95 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.93 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  35.59 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  29.66 
 
 		 280 aa  58.5  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  31.67 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  22.65 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  22.65 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.03 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.93 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.06 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  29.36 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1180  methyltransferase type 11  28.44 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  27.98 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0543  Methyltransferase type 11  28.23 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0668  Methyltransferase type 11  29.84 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  31.88 
 
 		 233 aa  57  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.33 
 
 		 420 aa  56.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  29.25 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3301  methyltransferase type 11  28.37 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0342  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  29.51 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1942  Methyltransferase type 11  32.12 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000627742  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  25.78 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  34.02 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.64 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.29 
 
 		 305 aa  55.5  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2646  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0860  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  29.92 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0650412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>