More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2423 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  100 
 
 		 254 aa  503  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  87.4 
 
 		 258 aa  412  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2234  Methyltransferase type 11  60.16 
 
 		 255 aa  274  9e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  hitchhiker  0.000669188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  52.19 
 
 		 251 aa  254  7e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4275  methyltransferase type 11  38.4 
 
 		 251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  38.31 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 261 aa  144  9e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  37.41 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  35.86 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3306  Methyltransferase type 11  39.04 
 
 		 249 aa  133  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2382  generic methyltransferase  31.97 
 
 		 243 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0942  Methyltransferase type 11  41.43 
 
 		 249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000927283 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  31.67 
 
 		 240 aa  125  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3074  hypothetical protein  35.74 
 
 		 248 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404761  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1301  Generic methyltransferase  35.74 
 
 		 248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2948  hypothetical protein  35.74 
 
 		 248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2259  Generic methyltransferase  36.59 
 
 		 248 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  34.54 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  30.19 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3322  methyltransferase type 12  28.29 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.595734  normal  0.302163 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6131  UbiE Methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0292  MCP methyltransferase, CheR-type  31.43 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1490  Methyltransferase type 11  27.49 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818174 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5370  Methyltransferase type 11  26.53 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.328033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3413  Methyltransferase type 12  28.02 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  24.39 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  31.11 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  36.53 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  45.45 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  33.13 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4625  hypothetical protein  29.32 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394037  normal  0.982559 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1028  methyltransferase type 11  33.79 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  42.31 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  43.69 
 
 		 284 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.07 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0713  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  43.09 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.919448  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  34.13 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  38.83 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.86 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1380  hypothetical protein  29.13 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0688  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  42.28 
 
 		 362 aa  62  0.000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1461  hypothetical protein  27.6 
 
 		 237 aa  62  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6865  Methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 282 aa  62  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  40 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3939  Methyltransferase type 12  34.76 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136325 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1003  hypothetical protein  27.6 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  37.25 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1485  hypothetical protein  27.6 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38639  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  42.37 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4536  methyltransferase type 12  29.19 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4056  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.09 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3855  Methyltransferase type 12  35.83 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  35.37 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  36.79 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  39.8 
 
 		 658 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4082  Methyltransferase type 11  34.46 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0740  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.16 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  39.62 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0611  hypothetical protein  26.29 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_550  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.77 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00760121  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4247  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.09 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225644  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  38 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_002950  PG1467  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.54 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2867  Methyltransferase type 11  41.41 
 
 		 355 aa  59.3  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1368  hypothetical protein  29.88 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  38.54 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 		 1032 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.07 
 
 		 386 aa  59.3  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0475  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  34.09 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  40.5 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1408  hypothetical protein  29.64 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2248  demethylmenaquinone methyltransferase  33.09 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0829  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.52 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.746498  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 295 aa  58.5  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  32.45 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0485  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.59 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.693247  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  38.26 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  37.27 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  37.84 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  32.3 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  42.48 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  41.03 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0785  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.46 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  38.38 
 
 		 711 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  32.47 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  31.55 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>