179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3413 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3413  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 255 aa  527  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0292  MCP methyltransferase, CheR-type  43.31 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4275  methyltransferase type 11  33.07 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3306  Methyltransferase type 11  33.2 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0942  Methyltransferase type 11  33.07 
 
 		 249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000927283 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  29.76 
 
 		 261 aa  87.8  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  27.56 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  27.84 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  28.02 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2234  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  hitchhiker  0.000669188 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  29.44 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  25.3 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  26.38 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  29.93 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  26.62 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 214 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  25.87 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  32.06 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2259  Generic methyltransferase  26.69 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1301  Generic methyltransferase  26.59 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2798  Methyltransferase type 12  31.93 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0280553  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3074  hypothetical protein  26.59 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404761  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2382  generic methyltransferase  23.94 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2948  hypothetical protein  26.59 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  34.95 
 
 		 254 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2840  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.998638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  33.96 
 
 		 297 aa  53.1  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  24.16 
 
 		 233 aa  52  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 444 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6880  Methyltransferase type 12  27.91 
 
 		 254 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0173101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1565  methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.132389  hitchhiker  0.000000000856384 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0890  hypothetical protein  31.03 
 
 		 227 aa  50.4  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  37.39 
 
 		 215 aa  50.4  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2390  methyltransferase type 11  35.85 
 
 		 439 aa  50.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.43 
 
 		 259 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 249 aa  50.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3321  methyltransferase type 12  31.01 
 
 		 204 aa  50.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.619193  normal  0.25285 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3719  methyltransferase type 12  27.68 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000247431  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  27.48 
 
 		 225 aa  49.3  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  29.82 
 
 		 399 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  31.31 
 
 		 251 aa  48.9  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 332 aa  48.5  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0899  methyltransferase type 12  32.06 
 
 		 215 aa  48.9  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784236 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.6 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  30.7 
 
 		 400 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  30.7 
 
 		 400 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 		 1314 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  29.14 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0150  methyltransferase type 12  29.2 
 
 		 199 aa  47.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1024  methionine biosynthesis protein MetW  30.67 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0141813 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2180  methyltransferase type 12  31.45 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  22.57 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  28.87 
 
 		 238 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  28.87 
 
 		 238 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4077  hypothetical protein  29.2 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1175  Methyltransferase type 12  29.5 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  28.47 
 
 		 229 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  28.44 
 
 		 276 aa  46.6  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1329  methyltransferase type 11  31.63 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  29.73 
 
 		 249 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  29.73 
 
 		 249 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  29.73 
 
 		 249 aa  46.6  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  29.73 
 
 		 249 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  29.73 
 
 		 249 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3449  methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0501  methyltransferase type 11  30.58 
 
 		 263 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 637 aa  46.6  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  29.73 
 
 		 249 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  29.73 
 
 		 249 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  27.45 
 
 		 237 aa  46.2  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  28.83 
 
 		 249 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.84 
 
 		 447 aa  46.2  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 244 aa  46.2  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  28.83 
 
 		 249 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  27.36 
 
 		 211 aa  45.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1580  methionine biosynthesis protein MetW  34.48 
 
 		 208 aa  45.8  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216776 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  27.91 
 
 		 447 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  27.91 
 
 		 447 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 344 aa  45.4  0.0009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1332  hypothetical protein  26.52 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.08 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  26.52 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  26.52 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1106  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  26.47 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3437  Methyltransferase type 11  26.95 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  28.07 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0547  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4859  hypothetical protein  31.48 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.069885 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.43 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  26.52 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3796  methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  32.43 
 
 		 395 aa  44.7  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02844  methyltransferase  31.58 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0543  methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 285 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1722  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0295021 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>