More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6131 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_6131  UbiE Methyltransferase type 11  100 
 
 		 289 aa  597  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5370  Methyltransferase type 11  62.37 
 
 		 288 aa  394  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.328033 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1490  Methyltransferase type 11  61.32 
 
 		 288 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818174 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  44.48 
 
 		 292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6137  methyltransferase UbiE  41.32 
 
 		 290 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3322  methyltransferase type 12  38.49 
 
 		 318 aa  196  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.595734  normal  0.302163 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  30.45 
 
 		 311 aa  132  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  31.73 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  30.42 
 
 		 251 aa  108  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  27.8 
 
 		 244 aa  99  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  30.56 
 
 		 240 aa  95.9  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4275  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 251 aa  92.4  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  30.33 
 
 		 244 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5629  Methyltransferase type 12  28.63 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1301  Generic methyltransferase  33.33 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2948  hypothetical protein  33.33 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3074  hypothetical protein  33.33 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404761  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2382  generic methyltransferase  27.88 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2259  Generic methyltransferase  33.49 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2661  hypothetical protein  34.27 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.588792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3306  Methyltransferase type 11  30.92 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  24.26 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1408  hypothetical protein  35.14 
 
 		 237 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3855  Methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4625  hypothetical protein  33.11 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394037  normal  0.982559 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1368  hypothetical protein  33.78 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  31.1 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  26 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2234  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  hitchhiker  0.000669188 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1461  hypothetical protein  33.11 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0942  Methyltransferase type 11  29.44 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000927283 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1003  hypothetical protein  37.5 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1485  hypothetical protein  37.5 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38639  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3939  Methyltransferase type 12  30.27 
 
 		 249 aa  67  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136325 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  32.9 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  28.82 
 
 		 274 aa  67  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  27.88 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1390  SAM-binding motif-containing protein  27.85 
 
 		 252 aa  65.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.671564 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1376  Methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.331989 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  32.68 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  33.04 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  33.08 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1616  hypothetical protein  26.76 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  25.28 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  30 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1380  hypothetical protein  29.41 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  35.87 
 
 		 531 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2539  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  35.87 
 
 		 527 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  35.87 
 
 		 527 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  28.49 
 
 		 672 aa  56.6  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3338  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 		 710 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  24.14 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  26.79 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0114  hypothetical protein  33.66 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  26.63 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  32.99 
 
 		 360 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 242 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 		 519 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  27.21 
 
 		 211 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 344 aa  55.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 242 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  24.59 
 
 		 204 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  28.14 
 
 		 237 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  27.34 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  29.89 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2729  Methyltransferase type 11  24.82 
 
 		 317 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3711  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 		 208 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  28.29 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2893  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 317 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  30 
 
 		 225 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 353 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 262 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  28.38 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  30.53 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6865  Methyltransferase type 11  27.34 
 
 		 282 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 274 aa  54.3  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  27.7 
 
 		 238 aa  54.3  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 219 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 289 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  32.05 
 
 		 352 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  37.76 
 
 		 265 aa  53.5  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 269 aa  53.5  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.52 
 
 		 252 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  32.19 
 
 		 261 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  30.22 
 
 		 281 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 275 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  27.13 
 
 		 272 aa  53.5  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0944  methyltransferase type 12  41.43 
 
 		 240 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 268 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>