72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1485 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1485  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38639  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1003  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1461  hypothetical protein  99.58 
 
 
237 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321475  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4625  hypothetical protein  93.25 
 
 
237 aa  454  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394037  normal  0.982559 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1368  hypothetical protein  87.34 
 
 
237 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1408  hypothetical protein  86.5 
 
 
237 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1380  hypothetical protein  64.85 
 
 
236 aa  314  6e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1757  methylase  42.26 
 
 
240 aa  192  6e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  29 
 
 
261 aa  92.4  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  34.74 
 
 
240 aa  90.9  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  29.26 
 
 
244 aa  88.6  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0093  methyltransferase type 12  36.95 
 
 
265 aa  88.2  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222843  normal  0.108853 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1301  Generic methyltransferase  31.28 
 
 
248 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2948  hypothetical protein  31.28 
 
 
248 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3074  hypothetical protein  31.28 
 
 
248 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404761  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  34.43 
 
 
244 aa  86.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3855  Methyltransferase type 12  30.98 
 
 
249 aa  86.3  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3939  Methyltransferase type 12  31.62 
 
 
249 aa  85.9  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136325 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2382  generic methyltransferase  29.44 
 
 
243 aa  85.5  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680927  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  27.92 
 
 
292 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2259  Generic methyltransferase  30.84 
 
 
248 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  29.44 
 
 
242 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3322  methyltransferase type 12  29.2 
 
 
318 aa  75.9  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.595734  normal  0.302163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4275  methyltransferase type 11  27.67 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5629  Methyltransferase type 12  31.97 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  28.12 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6131  UbiE Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  29.25 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2234  Methyltransferase type 11  27.53 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  hitchhiker  0.000669188 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  29.19 
 
 
527 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  33.86 
 
 
276 aa  62.8  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  28.48 
 
 
527 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  33.97 
 
 
233 aa  62  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1057  putative pristinamycin I synthase 3  28.97 
 
 
243 aa  62  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00377731 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5370  Methyltransferase type 11  32.84 
 
 
288 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.328033 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  27.6 
 
 
254 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2661  hypothetical protein  36.63 
 
 
261 aa  60.5  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.588792  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0847  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 
272 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.988937  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
531 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1490  Methyltransferase type 11  32.84 
 
 
288 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000818174 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3306  Methyltransferase type 11  26.51 
 
 
249 aa  60.1  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1390  SAM-binding motif-containing protein  29.71 
 
 
252 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.671564 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0533  type 12 methyltransferase  27.36 
 
 
260 aa  56.6  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324241  decreased coverage  0.00341349 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08180  methyltransferase family protein  27.43 
 
 
246 aa  56.6  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  31.13 
 
 
264 aa  54.7  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1376  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
274 aa  53.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.331989 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4115  methyltransferase type 12  35.14 
 
 
237 aa  52.4  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  26.71 
 
 
519 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5899  Methyltransferase type 11  27.82 
 
 
230 aa  52  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.331708  normal  0.516672 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4536  methyltransferase type 12  39.77 
 
 
237 aa  52  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0397  Methyltransferase type 12  30.92 
 
 
259 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  27.75 
 
 
274 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0388  Methyltransferase type 12  30.92 
 
 
259 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  27.2 
 
 
258 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0942  Methyltransferase type 11  25 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000927283 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1427  methyltransferase type 12  28.47 
 
 
251 aa  47  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  28.05 
 
 
239 aa  45.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1601  Methyltransferase type 11  30.86 
 
 
212 aa  45.4  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.624379  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  26.22 
 
 
237 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  26.54 
 
 
241 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2893  methyltransferase type 11  28.74 
 
 
317 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6137  methyltransferase UbiE  28.12 
 
 
290 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5473  Methyltransferase type 12  38.81 
 
 
250 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 
196 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  28.39 
 
 
1162 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0944  methyltransferase type 12  28.07 
 
 
240 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242439  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 
255 aa  42.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6255  methyltransferase domain-containing protein  23.95 
 
 
257 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  30.06 
 
 
194 aa  42  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1345  hypothetical protein  29.37 
 
 
231 aa  42  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  28.93 
 
 
361 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>