More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0254 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 273 aa  539  9.999999999999999e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6478  methyltransferase type 11  63.67 
 
 		 269 aa  326  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0560724  normal  0.10851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  62.45 
 
 		 270 aa  319  3e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  57.03 
 
 		 272 aa  310  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  61.42 
 
 		 272 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  59.39 
 
 		 283 aa  296  3e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  55.51 
 
 		 271 aa  295  5e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  60.23 
 
 		 264 aa  292  3e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  60.08 
 
 		 275 aa  289  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  53.96 
 
 		 270 aa  275  5e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  54.34 
 
 		 296 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  55.94 
 
 		 265 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  56.49 
 
 		 267 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  56.7 
 
 		 272 aa  268  5.9999999999999995e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07175  ubiE/COQ5 methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03321)  51.35 
 
 		 313 aa  265  5.999999999999999e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38441  normal  0.150354 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  51.13 
 
 		 285 aa  260  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  32.96 
 
 		 275 aa  156  4e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  41.72 
 
 		 269 aa  99  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0101  Methyltransferase type 11  35.89 
 
 		 272 aa  89.4  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.31 
 
 		 243 aa  87.8  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  35.76 
 
 		 273 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  30.86 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  35 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1022  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0006  hypothetical protein  29.17 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.868865  normal  0.0557095 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  46.32 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1020  Methyltransferase type 11  27.46 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.833494 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  43.12 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2107  methyltransferase type 11  36.42 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  32.97 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  28.72 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2043  methyltransferase type 11  38.33 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1849  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2762  Methyltransferase type 11  41.13 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  39.52 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  45.63 
 
 		 250 aa  75.5  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  28.64 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  48.04 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.94 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  42.27 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  36.43 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0114  hypothetical protein  33.58 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  33.54 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  38.84 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  40.8 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  43.24 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  26.02 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  26.02 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3681  methyltransferase type 11  29.19 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  36.3 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.82 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.3 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1100  methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 313 aa  72.4  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  40.37 
 
 		 295 aa  72  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1769  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 273 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  35.78 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  35.34 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.94 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  41 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  37.17 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  34.24 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  43.24 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  33.55 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  37.82 
 
 		 581 aa  70.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  37.62 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  35.34 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  34.36 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  39.32 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  31.1 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  33.62 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  37.9 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1915  methyltransferase type 11  38.4 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0565033  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  38.18 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.34 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  34.3 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.42 
 
 		 420 aa  69.3  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  30.27 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1967  methyltransferase type 11  43.81 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.527194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  43.4 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  40.71 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3189  MCP methyltransferase, CheR-type  31.07 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00181305  normal  0.0716024 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  39.25 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  34.11 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  33.12 
 
 		 624 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2303  Methyltransferase type 11  34.26 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.342078  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  39.82 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  27.32 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  35.94 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3829  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  36.89 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>