More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1020 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1020  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 273 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.833494 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1409  methyltransferase type 12  55.6 
 
 		 269 aa  278  8e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2045  Methyltransferase type 11  49.03 
 
 		 267 aa  275  7e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000233397  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2173  Methyltransferase type 11  49.42 
 
 		 267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3235  methyltransferase type 11  49.42 
 
 		 271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  31.48 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  27.46 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  31.06 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  32.57 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4416  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  27.89 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  29.01 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0491  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.5 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0786  hypothetical protein  27.67 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.27206  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2605  hypothetical protein  33.33 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3829  Methyltransferase type 11  27.08 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  36.8 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1234  hypothetical protein  30.84 
 
 		 524 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0873345 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  28.04 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1457  AMP-dependent synthetase and ligase  29.32 
 
 		 853 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805076  normal  0.11839 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  29.5 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2732  hypothetical protein  31.75 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1714  ATPase  35.96 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000845008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  32.14 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  32.34 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2662  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  35.54 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.360692  normal  0.0481393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9102  hypothetical protein  27.89 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  30.6 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3681  methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.14 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  35.25 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  26.41 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.14 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  31.17 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07175  ubiE/COQ5 methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03321)  23.3 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38441  normal  0.150354 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  28.35 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00200  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3349  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 145 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0101  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.29 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.29 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  30.08 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3792  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.19 
 
 		 251 aa  57  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  25.25 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  36 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.62 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2290  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  28.22 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0457  methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25 
 
 		 330 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.71 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3202  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  30.57 
 
 		 251 aa  55.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  24.74 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0506  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.48 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2758  demethylmenaquinone methyltransferase  31.25 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  30.11 
 
 		 304 aa  54.3  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  29.76 
 
 		 268 aa  54.7  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6478  methyltransferase type 11  29.59 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0560724  normal  0.10851 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2550  methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 348 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00904798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.48 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.43 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3551  demethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0405  demethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.403287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3725  demethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0431  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.48 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159062  hitchhiker  0.0000667 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3895  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.48 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.4649  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0445  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.48 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187756  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4199  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  29.94 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  25.95 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 276 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3804  methyltransferase type 11  33.91 
 
 		 279 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 221 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0461  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  34.19 
 
 		 251 aa  53.5  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14886  predicted protein  30.7 
 
 		 309 aa  53.5  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.468238  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0475  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  32.48 
 
 		 251 aa  53.1  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  22.75 
 
 		 275 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0808  methyltransferase type 11  28.75 
 
 		 182 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0203629 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 267 aa  53.1  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  28.76 
 
 		 284 aa  53.1  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  34.45 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  34.45 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  34.45 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0294  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  28.89 
 
 		 271 aa  52.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00915266  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  30.71 
 
 		 310 aa  52.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0215  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  35.29 
 
 		 244 aa  52.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.303919 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 200 aa  52.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  29.31 
 
 		 353 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3178  methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 239 aa  52.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.184817 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 337 aa  52.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 244 aa  52.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.12 
 
 		 273 aa  52.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 246 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>