More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3189 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3189  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
297 aa  611  9.999999999999999e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00181305  normal  0.0716024 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2184  Methyltransferase type 11  41.95 
 
 
293 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35 
 
 
265 aa  79  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1926  Methyltransferase type 11  42.98 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  35 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  41.82 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
295 aa  69.3  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.76 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  29.76 
 
 
285 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.38 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0785  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.66 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0294  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  28.72 
 
 
271 aa  66.6  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00915266  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  38.53 
 
 
263 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 
415 aa  66.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  40.52 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  29.71 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4146  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.75 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4305  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.75 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4057  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.75 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4354  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.75 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.556022  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4175  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.75 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5274  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.75 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.123369  normal  0.211011 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4216  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.75 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227535 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  37.78 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4250  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.19 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.19 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  32.6 
 
 
409 aa  65.5  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4357  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.19 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4297  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.19 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.19 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.962772  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  40.37 
 
 
284 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.04 
 
 
272 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.68 
 
 
285 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  37.39 
 
 
246 aa  65.1  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2996  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.04 
 
 
254 aa  65.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  37.84 
 
 
279 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  35.65 
 
 
235 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3960  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.19 
 
 
251 aa  65.1  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.32 
 
 
283 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  35.17 
 
 
1005 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00562  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.96 
 
 
259 aa  64.7  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  33.08 
 
 
273 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  26.79 
 
 
280 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.69 
 
 
253 aa  64.3  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.9 
 
 
251 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  37.84 
 
 
265 aa  63.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00700  conserved hypothetical protein  32.37 
 
 
239 aa  63.5  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0713  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  36.13 
 
 
374 aa  63.5  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.919448  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.04 
 
 
248 aa  63.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.98 
 
 
261 aa  63.5  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  36.94 
 
 
267 aa  63.5  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03675  hypothetical protein  33.9 
 
 
251 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0688  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  36.13 
 
 
362 aa  63.5  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  34.53 
 
 
274 aa  63.5  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.11 
 
 
260 aa  63.5  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  35.04 
 
 
288 aa  63.2  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  35.65 
 
 
238 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.86 
 
 
215 aa  63.2  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 
261 aa  63.2  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0542  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  31.72 
 
 
261 aa  62.8  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  41.28 
 
 
286 aa  62.8  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001927  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE/COQ5  36.11 
 
 
259 aa  62.8  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  36.91 
 
 
257 aa  62.4  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.54 
 
 
262 aa  62.4  0.000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  31.03 
 
 
278 aa  62.4  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  38.74 
 
 
262 aa  62.4  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  37.6 
 
 
355 aa  62.4  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  40.57 
 
 
226 aa  62.4  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.04 
 
 
238 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.41 
 
 
280 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  38.74 
 
 
279 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.77 
 
 
276 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1110  hypothetical protein  33.59 
 
 
267 aa  62  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0860  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  38.6 
 
 
243 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0650412 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  30.25 
 
 
251 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 
265 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  28.57 
 
 
285 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.17 
 
 
237 aa  62  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.04 
 
 
236 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0323  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  31.78 
 
 
251 aa  62.4  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.94 
 
 
280 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 
250 aa  61.2  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  36.5 
 
 
241 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_002978  WD0393  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  28.19 
 
 
238 aa  61.2  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  30.81 
 
 
270 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.9 
 
 
259 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1317  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.73 
 
 
263 aa  61.6  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7094  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.56 
 
 
244 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000661752  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2859  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.74 
 
 
287 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 
298 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.63 
 
 
264 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 
310 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  32.23 
 
 
301 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3549  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40 
 
 
265 aa  61.2  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
209 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  34.31 
 
 
261 aa  60.8  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  34.45 
 
 
287 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2645  methyltransferase type 11  26.42 
 
 
262 aa  60.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75506  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>