More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0749 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  100 
 
 
295 aa  602  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  80.68 
 
 
295 aa  495  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  42.81 
 
 
282 aa  210  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1559  hypothetical protein  41.86 
 
 
208 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00538046  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2109  methyltransferase type 11  34.39 
 
 
296 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.709004  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1836  Methyltransferase type 11  33.6 
 
 
296 aa  120  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0725  Methyltransferase type 11  33.6 
 
 
313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2411  methyltransferase type 11  32.95 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  34.27 
 
 
271 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  33.18 
 
 
274 aa  99.8  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1057  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 
292 aa  99.8  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.783467  hitchhiker  0.00010073 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1411  Methyltransferase type 11  36.49 
 
 
292 aa  98.2  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.456001  normal  0.135358 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3261  SAM-dependent methyltransferase  34.48 
 
 
287 aa  95.9  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234445  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  39.6 
 
 
382 aa  92.8  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  36.02 
 
 
261 aa  90.1  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  35.77 
 
 
281 aa  89  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  27.46 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  34.69 
 
 
278 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  36.54 
 
 
279 aa  87.8  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  29.95 
 
 
304 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  38.84 
 
 
284 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  33.78 
 
 
310 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  36.3 
 
 
282 aa  87  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  31.84 
 
 
311 aa  86.7  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  29.6 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  28.39 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19461  SAM-binding motif-containing protein  33.11 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  27.66 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  30.35 
 
 
310 aa  82.4  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  27.8 
 
 
328 aa  82  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  30.35 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  28.51 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  28.51 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  36.02 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  30.43 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2025  sterol-C-methyltransferase  35.81 
 
 
310 aa  79  0.00000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0984  methyltransferase type 11  39.82 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07721  methyltransferase  36.89 
 
 
353 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0608577 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0140  methyltransferase  36.89 
 
 
353 aa  77.4  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  40.74 
 
 
258 aa  77  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.97 
 
 
305 aa  76.3  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  28.89 
 
 
280 aa  76.6  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.41 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  37.5 
 
 
832 aa  75.9  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  27.53 
 
 
283 aa  75.5  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  36.21 
 
 
387 aa  75.5  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2147  methyltransferase type 11  28.5 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.87 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  28.09 
 
 
283 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  35.56 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16301  methyltransferase  39.09 
 
 
357 aa  73.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.346442 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12966  methyltransferase  38.66 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  39.37 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  33.04 
 
 
377 aa  72.8  0.000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  33.54 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  36.31 
 
 
711 aa  72.4  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  32.46 
 
 
377 aa  72.4  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  35.96 
 
 
347 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  40.37 
 
 
273 aa  72  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0183  methyltransferase type 11  39.83 
 
 
223 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0293588  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  30 
 
 
268 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  30 
 
 
268 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  27.61 
 
 
392 aa  71.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10269  predicted protein  28.22 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.46 
 
 
235 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  34.33 
 
 
1012 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  34.88 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2958  hypothetical protein  35.78 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  40.16 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.96 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 
276 aa  68.9  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.77 
 
 
215 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3246  Methyltransferase type 11  37.61 
 
 
255 aa  68.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00392072  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  33.56 
 
 
342 aa  68.9  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  38.6 
 
 
269 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1652  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.52 
 
 
254 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.583368 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  38.6 
 
 
269 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5837  Methyltransferase type 11  34.04 
 
 
206 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0373  Methyltransferase type 11  38.4 
 
 
222 aa  68.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  40.57 
 
 
710 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.46 
 
 
252 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  30.07 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  40.68 
 
 
239 aa  68.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1282  methyltransferase type 11  37.4 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  31.01 
 
 
206 aa  68.2  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  25.97 
 
 
280 aa  67  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
276 aa  67  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  31.76 
 
 
240 aa  67.4  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  37.19 
 
 
217 aa  67  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  29.87 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  30.3 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  31.36 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  36.07 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  35.86 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  37.07 
 
 
288 aa  65.5  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  31.62 
 
 
343 aa  65.1  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1026  methyltransferase type 11  32.51 
 
 
277 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>