More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1836 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1836  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 296 aa  610  1e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2109  methyltransferase type 11  93.58 
 
 		 296 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.709004  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0725  Methyltransferase type 11  90.54 
 
 		 313 aa  552  1e-156  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1411  Methyltransferase type 11  80.82 
 
 		 292 aa  489  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.456001  normal  0.135358 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1057  Methyltransferase type 11  80.14 
 
 		 292 aa  488  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.783467  hitchhiker  0.00010073 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0984  methyltransferase type 11  52.6 
 
 		 300 aa  285  8e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  33.6 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  39.05 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  38.57 
 
 		 271 aa  86.7  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  36.24 
 
 		 274 aa  86.3  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  26.99 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3261  SAM-dependent methyltransferase  32.69 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  26.27 
 
 		 280 aa  82  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  26.73 
 
 		 278 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  34.16 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.95 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.97 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  33.54 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  29.19 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  30.05 
 
 		 261 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  34.39 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0997  methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.698305 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  35.78 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2645  methyltransferase type 11  31.02 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.41 
 
 		 283 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  38 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  38.18 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.54 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1559  hypothetical protein  36.19 
 
 		 208 aa  71.6  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00538046  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.21 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  38.05 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  26.99 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.78 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.43 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  30.64 
 
 		 347 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  30.15 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.54 
 
 		 280 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.72 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  31.76 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.86 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0499  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000709402  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0228  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  34.71 
 
 		 1012 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  32.64 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  29.76 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  27.64 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  27.8 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  32.03 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0591  Methyltransferase type 11  30.49 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.812194 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  29.28 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1112  methyltransferase type 11  38.33 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0760451  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5837  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  34.58 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4218  methyltransferase type 11  29.82 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  34.95 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2147  methyltransferase type 11  30.99 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.63 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  32.52 
 
 		 832 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.43 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1715  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7094  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.2 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000661752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1636  methyltransferase type 11  36.75 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.431948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2791  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.74 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1027  Methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 411 aa  62.4  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1710  methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2642  Methyltransferase type 11  27.98 
 
 		 390 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0172  methyltransferase type 11  33.81 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.94 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  31.76 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.94 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2411  methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  29.52 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.04 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  26.59 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0977  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.81 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.270473 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  29.01 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  27.83 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1113  methyltransferase type 11  30.65 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629842  normal  0.748747 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  32.06 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12966  methyltransferase  24.36 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  33.91 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3681  methyltransferase type 11  27.22 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  33.04 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  28.45 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2303  Methyltransferase type 11  27.44 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.342078  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>