More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2880 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  100 
 
 
246 aa  471  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  52.36 
 
 
283 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  54.8 
 
 
265 aa  236  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  52.43 
 
 
271 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  51.13 
 
 
276 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  49.38 
 
 
241 aa  209  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  46.91 
 
 
355 aa  208  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  50.88 
 
 
276 aa  202  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  44.49 
 
 
270 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0104  Methyltransferase type 11  51.54 
 
 
260 aa  192  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  44.4 
 
 
262 aa  189  4e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3743  methyltransferase type 11  47.19 
 
 
267 aa  186  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1224  methyltransferase type 11  57.22 
 
 
282 aa  186  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.158383  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0591  Methyltransferase type 11  50.43 
 
 
263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.812194 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0110  methyltransferase type 11  52.49 
 
 
274 aa  181  8.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3346  Methyltransferase type 11  45.32 
 
 
265 aa  181  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408224  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  44.54 
 
 
266 aa  180  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0499  Methyltransferase type 11  47.37 
 
 
264 aa  180  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000709402  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  39.16 
 
 
263 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  45.13 
 
 
267 aa  177  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3376  Methyltransferase type 11  46.74 
 
 
256 aa  175  5e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0407493  hitchhiker  0.00438973 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  41.83 
 
 
268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  44.03 
 
 
288 aa  172  5e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  44.21 
 
 
272 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  50.26 
 
 
295 aa  169  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  48.4 
 
 
265 aa  167  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  46.53 
 
 
237 aa  167  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  43.88 
 
 
279 aa  164  9e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  42.79 
 
 
273 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  41.15 
 
 
277 aa  163  3e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  42.08 
 
 
280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  45.76 
 
 
277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  42.41 
 
 
267 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  49.08 
 
 
248 aa  159  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04625  arsenic methyltransferase Cyt19, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G15020)  46.32 
 
 
282 aa  158  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1710  methyltransferase type 11  44.56 
 
 
262 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  35.84 
 
 
298 aa  149  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  40.99 
 
 
280 aa  149  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2791  arsenite S-adenosylmethyltransferase  44.71 
 
 
266 aa  148  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1926  Methyltransferase type 11  42.8 
 
 
281 aa  148  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.32 
 
 
279 aa  145  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1514  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.11 
 
 
280 aa  143  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.732855  normal  0.394631 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  43.35 
 
 
1014 aa  142  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1027  Methyltransferase type 11  45.16 
 
 
258 aa  141  9e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4114  Methyltransferase type 11  34.4 
 
 
365 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.199074  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1636  methyltransferase type 11  40.35 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.431948  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4075  Methyltransferase type 11  34 
 
 
365 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00700  conserved hypothetical protein  41.07 
 
 
239 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0923  Methyltransferase type 11  41.29 
 
 
1039 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2645  methyltransferase type 11  43.01 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75506  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08531  putative methyltransferase  38.91 
 
 
267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2227  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 
396 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372982 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  41.28 
 
 
409 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1196  Methyltransferase type 11  42.39 
 
 
259 aa  128  8.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  40.64 
 
 
1005 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  38.73 
 
 
1000 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0301  methyltransferase type 11  35.98 
 
 
380 aa  127  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3607  Methyltransferase type 11  31.92 
 
 
307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.289928  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3308  methyltransferase type 11  43.65 
 
 
239 aa  125  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.358181  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3113  Methyltransferase type 11  37.66 
 
 
350 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00520497  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1984  methyltransferase-like  37.73 
 
 
270 aa  123  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0411  hypothetical protein  34.2 
 
 
264 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0624483  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  36.23 
 
 
1002 aa  123  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04351  putative methyltransferase  33.33 
 
 
264 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04141  putative methyltransferase  37.5 
 
 
241 aa  122  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1991  methyltransferase type 11  31.08 
 
 
411 aa  121  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0896  Methyltransferase type 11  42.61 
 
 
350 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04661  putative methyltransferase  33.33 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0677  methyltransferase-like  37.27 
 
 
266 aa  120  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1418  methyltransferase type 11  34.12 
 
 
379 aa  119  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.685062  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1715  Methyltransferase type 11  36.28 
 
 
411 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  37.31 
 
 
209 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04771  putative methyltransferase  31.86 
 
 
264 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2358  methyltransferase type 11  43.75 
 
 
216 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.53267  normal  0.0101141 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28006  predicted protein  40.22 
 
 
418 aa  108  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.122244 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39627  predicted protein  34.39 
 
 
410 aa  106  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3171  methyltransferase type 11  42.76 
 
 
204 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1914  Methyltransferase type 11  33.18 
 
 
324 aa  105  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0586  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.78 
 
 
346 aa  99.8  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1612  UbiE/COQ5 methyltransferase  40 
 
 
356 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05015  hypothetical protein  29.78 
 
 
322 aa  98.6  9e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1156  methyltransferase  37.87 
 
 
355 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3797  hypothetical protein  34.13 
 
 
350 aa  96.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_25654  predicted protein  42.7 
 
 
200 aa  95.9  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3557  Methyltransferase type 11  42.04 
 
 
369 aa  94  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0388  type 11 methyltransferase  31.56 
 
 
322 aa  93.6  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2550  methyltransferase type 11  35.88 
 
 
348 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00904798  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  38.24 
 
 
291 aa  90.1  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2318  methyltransferase type 11  38.15 
 
 
349 aa  87  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399773  normal  0.0108051 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3620  hypothetical protein  34.55 
 
 
346 aa  85.5  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.615774  normal  0.159076 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  43.97 
 
 
265 aa  85.1  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  41.46 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  39.62 
 
 
261 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  32.47 
 
 
270 aa  82  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.04 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.75 
 
 
215 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  32.32 
 
 
301 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0600  methyltransferase type 11  38.94 
 
 
218 aa  79  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.93996  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0172  methyltransferase type 11  35.32 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>