More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3346 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3346  Methyltransferase type 11  100 
 
 
265 aa  528  1e-149  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408224  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0104  Methyltransferase type 11  68.54 
 
 
260 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3743  methyltransferase type 11  66.42 
 
 
267 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3376  Methyltransferase type 11  69.32 
 
 
256 aa  308  5e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0407493  hitchhiker  0.00438973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  59.77 
 
 
265 aa  288  5.0000000000000004e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  54.77 
 
 
283 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  53.97 
 
 
276 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  55.22 
 
 
271 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  49.61 
 
 
355 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  50.2 
 
 
276 aa  224  8e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  49.61 
 
 
241 aa  218  7.999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0591  Methyltransferase type 11  52.33 
 
 
263 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.812194 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  46.28 
 
 
270 aa  209  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  47.48 
 
 
279 aa  206  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  42.38 
 
 
263 aa  201  8e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  47.84 
 
 
277 aa  199  5e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  47.84 
 
 
277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0110  methyltransferase type 11  44 
 
 
274 aa  196  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  44.07 
 
 
268 aa  195  5.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  46.55 
 
 
280 aa  195  6e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  43.54 
 
 
272 aa  192  6e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  43.17 
 
 
266 aa  191  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  50.49 
 
 
246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  42.56 
 
 
262 aa  189  5e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  51.52 
 
 
265 aa  186  4e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1224  methyltransferase type 11  45.78 
 
 
282 aa  185  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.158383  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  46.03 
 
 
267 aa  182  6e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  42.24 
 
 
295 aa  178  7e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  44.12 
 
 
280 aa  176  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  52.73 
 
 
273 aa  174  9e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  42.02 
 
 
267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2791  arsenite S-adenosylmethyltransferase  43.51 
 
 
266 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  53.75 
 
 
248 aa  169  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  44.63 
 
 
288 aa  168  7e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.476258 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04625  arsenic methyltransferase Cyt19, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G15020)  48.95 
 
 
282 aa  167  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0499  Methyltransferase type 11  39.38 
 
 
264 aa  167  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000709402  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1926  Methyltransferase type 11  44.21 
 
 
281 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  42.24 
 
 
237 aa  162  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00700  conserved hypothetical protein  42.35 
 
 
239 aa  161  1e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1514  arsenite S-adenosylmethyltransferase  39.75 
 
 
280 aa  159  6e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.732855  normal  0.394631 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  39.85 
 
 
279 aa  158  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  40 
 
 
298 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  42.72 
 
 
1014 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  43.96 
 
 
1002 aa  144  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0923  Methyltransferase type 11  39.24 
 
 
1039 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  39.25 
 
 
1000 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28006  predicted protein  43.01 
 
 
418 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.122244 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1027  Methyltransferase type 11  41.76 
 
 
258 aa  136  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1710  methyltransferase type 11  39.55 
 
 
262 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1196  Methyltransferase type 11  41.62 
 
 
259 aa  132  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4114  Methyltransferase type 11  36.52 
 
 
365 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.199074  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0677  methyltransferase-like  40.8 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4075  Methyltransferase type 11  36.52 
 
 
365 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2227  Methyltransferase type 11  36.82 
 
 
396 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372982 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2645  methyltransferase type 11  41.21 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75506  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0301  methyltransferase type 11  38.18 
 
 
380 aa  127  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1418  methyltransferase type 11  36.65 
 
 
379 aa  127  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.685062  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  38.62 
 
 
1005 aa  126  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0896  Methyltransferase type 11  45.09 
 
 
350 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3607  Methyltransferase type 11  31.21 
 
 
307 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.289928  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39627  predicted protein  37.04 
 
 
410 aa  122  5e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3113  Methyltransferase type 11  35.54 
 
 
350 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00520497  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  44.6 
 
 
209 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1984  methyltransferase-like  38.31 
 
 
270 aa  120  3e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1612  UbiE/COQ5 methyltransferase  45.83 
 
 
356 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1636  methyltransferase type 11  38.98 
 
 
261 aa  118  7.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.431948  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08531  putative methyltransferase  37.81 
 
 
267 aa  118  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04141  putative methyltransferase  34.31 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04771  putative methyltransferase  33.66 
 
 
264 aa  115  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0586  UbiE/COQ5 methyltransferase  45.24 
 
 
346 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0411  hypothetical protein  32.68 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0624483  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3557  Methyltransferase type 11  37.15 
 
 
369 aa  113  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  33.74 
 
 
409 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04351  putative methyltransferase  32.51 
 
 
264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2318  methyltransferase type 11  35.15 
 
 
349 aa  112  8.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399773  normal  0.0108051 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_25654  predicted protein  50.36 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3308  methyltransferase type 11  39.8 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.358181  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04661  putative methyltransferase  32.02 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1715  Methyltransferase type 11  34.36 
 
 
411 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3171  methyltransferase type 11  48.55 
 
 
204 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1991  methyltransferase type 11  33.62 
 
 
411 aa  109  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1156  methyltransferase  40.48 
 
 
355 aa  108  6e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2358  methyltransferase type 11  41.62 
 
 
216 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.53267  normal  0.0101141 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2550  methyltransferase type 11  38.19 
 
 
348 aa  106  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00904798  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3620  hypothetical protein  32.37 
 
 
346 aa  99.4  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.615774  normal  0.159076 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  40.68 
 
 
271 aa  97.8  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  40.96 
 
 
261 aa  96.3  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1914  Methyltransferase type 11  32.97 
 
 
324 aa  96.3  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05015  hypothetical protein  31.67 
 
 
322 aa  95.5  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  39.87 
 
 
271 aa  93.6  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  41.28 
 
 
275 aa  87  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3797  hypothetical protein  31.35 
 
 
350 aa  82  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  32.6 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.25 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0388  type 11 methyltransferase  28.65 
 
 
322 aa  79  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  43.81 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4839  putative methyltransferase  39.67 
 
 
271 aa  76.6  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1411  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.456001  normal  0.135358 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
337 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>