More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1202 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  100 
 
 
277 aa  556  1e-157  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  90 
 
 
280 aa  456  1e-127  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  88.49 
 
 
277 aa  450  1e-125  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  49.82 
 
 
279 aa  265  7e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  55.17 
 
 
262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  50.96 
 
 
272 aa  253  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  54.59 
 
 
268 aa  244  9e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  52.89 
 
 
265 aa  241  1e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  54.87 
 
 
266 aa  239  4e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  53.51 
 
 
263 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  49.12 
 
 
267 aa  224  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  47.77 
 
 
288 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2791  arsenite S-adenosylmethyltransferase  48.91 
 
 
266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  50.43 
 
 
267 aa  218  7.999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  53.39 
 
 
273 aa  217  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  52.16 
 
 
248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  52 
 
 
295 aa  209  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  47.84 
 
 
283 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1926  Methyltransferase type 11  47.66 
 
 
281 aa  206  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  48.02 
 
 
279 aa  205  8e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  47.95 
 
 
237 aa  205  8e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  46.38 
 
 
276 aa  202  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  47.44 
 
 
298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  46.09 
 
 
276 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  47.95 
 
 
271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  46.61 
 
 
265 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3346  Methyltransferase type 11  48.12 
 
 
265 aa  190  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408224  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0104  Methyltransferase type 11  48.23 
 
 
260 aa  189  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00700  conserved hypothetical protein  42.91 
 
 
239 aa  187  1e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04625  arsenic methyltransferase Cyt19, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G15020)  42.46 
 
 
282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1224  methyltransferase type 11  50.98 
 
 
282 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.158383  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1514  arsenite S-adenosylmethyltransferase  43.42 
 
 
280 aa  183  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.732855  normal  0.394631 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  44.92 
 
 
270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  45.3 
 
 
280 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0110  methyltransferase type 11  45.29 
 
 
274 aa  182  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3743  methyltransferase type 11  53.44 
 
 
267 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3376  Methyltransferase type 11  58.02 
 
 
256 aa  176  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0407493  hitchhiker  0.00438973 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0499  Methyltransferase type 11  41.6 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000709402  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  47.92 
 
 
1014 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  39.66 
 
 
355 aa  165  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0591  Methyltransferase type 11  39.66 
 
 
263 aa  165  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.812194 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  45.76 
 
 
246 aa  162  8.000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  39.66 
 
 
241 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1710  methyltransferase type 11  41.59 
 
 
262 aa  155  8e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1027  Methyltransferase type 11  39.13 
 
 
258 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2645  methyltransferase type 11  46.07 
 
 
262 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75506  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0923  Methyltransferase type 11  46.67 
 
 
1039 aa  153  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1196  Methyltransferase type 11  43.01 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3113  Methyltransferase type 11  38.79 
 
 
350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00520497  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  41.97 
 
 
1002 aa  144  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  39.06 
 
 
1000 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1636  methyltransferase type 11  44.94 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.431948  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3308  methyltransferase type 11  46.07 
 
 
239 aa  138  8.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.358181  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39627  predicted protein  37.23 
 
 
410 aa  138  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  39.9 
 
 
1005 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3620  hypothetical protein  36.48 
 
 
346 aa  135  7.000000000000001e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.615774  normal  0.159076 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0896  Methyltransferase type 11  37.29 
 
 
350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1715  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 
411 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3557  Methyltransferase type 11  36.21 
 
 
369 aa  128  9.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0586  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.86 
 
 
346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0301  methyltransferase type 11  38.68 
 
 
380 aa  128  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4114  Methyltransferase type 11  32.97 
 
 
365 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.199074  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1612  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.81 
 
 
356 aa  126  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  34.72 
 
 
409 aa  126  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4075  Methyltransferase type 11  32.97 
 
 
365 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  40.65 
 
 
209 aa  125  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1156  methyltransferase  34.07 
 
 
355 aa  125  9e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_25654  predicted protein  41.26 
 
 
200 aa  125  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2227  Methyltransferase type 11  36.49 
 
 
396 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372982 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0677  methyltransferase-like  35.47 
 
 
266 aa  123  4e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2550  methyltransferase type 11  33.9 
 
 
348 aa  123  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00904798  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2358  methyltransferase type 11  41.67 
 
 
216 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.53267  normal  0.0101141 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28006  predicted protein  35.02 
 
 
418 aa  121  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.122244 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3607  Methyltransferase type 11  31 
 
 
307 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.289928  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08531  putative methyltransferase  33.91 
 
 
267 aa  118  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3171  methyltransferase type 11  46.21 
 
 
204 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1418  methyltransferase type 11  36.1 
 
 
379 aa  116  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.685062  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1991  methyltransferase type 11  32.1 
 
 
411 aa  116  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04771  putative methyltransferase  34.6 
 
 
264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2318  methyltransferase type 11  34.93 
 
 
349 aa  115  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399773  normal  0.0108051 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04141  putative methyltransferase  34.24 
 
 
241 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04351  putative methyltransferase  32.23 
 
 
264 aa  109  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1984  methyltransferase-like  39.08 
 
 
270 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04661  putative methyltransferase  31.95 
 
 
264 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0411  hypothetical protein  31.97 
 
 
264 aa  105  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0624483  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4641  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.31 
 
 
296 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1914  Methyltransferase type 11  31.77 
 
 
324 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  40.71 
 
 
415 aa  95.5  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05015  hypothetical protein  28.57 
 
 
322 aa  86.3  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0388  type 11 methyltransferase  28.57 
 
 
322 aa  86.3  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3797  hypothetical protein  29.07 
 
 
350 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  40.71 
 
 
258 aa  85.1  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  36.69 
 
 
261 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  32.93 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  42.11 
 
 
251 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  42.11 
 
 
251 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  32.85 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  34.9 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  33.73 
 
 
776 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  31.12 
 
 
301 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>