More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5837 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5837  Methyltransferase type 11  100 
 
 
206 aa  411  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1964  methyltransferase type 11  38.38 
 
 
212 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2010  methyltransferase type 11  38.38 
 
 
212 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1944  methyltransferase type 11  38.38 
 
 
212 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.108807  normal  0.982721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10334  hypothetical protein  36.46 
 
 
208 aa  103  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.672272 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2597  methyltransferase type 11  34.04 
 
 
236 aa  101  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.254327  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4275  methyltransferase type 11  41.45 
 
 
236 aa  97.1  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7117  Methyltransferase type 11  34.94 
 
 
229 aa  95.1  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.829004  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1282  methyltransferase type 11  36.67 
 
 
220 aa  94.7  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6852  Methyltransferase type 11  28.71 
 
 
217 aa  93.6  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18943  normal  0.739847 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2418  Methyltransferase type 11  34.83 
 
 
216 aa  91.7  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.224648 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1161  methyltransferase type 11  24.74 
 
 
196 aa  86.7  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1512  methyltransferase type 11  26.34 
 
 
217 aa  86.7  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 
223 aa  85.9  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1147  SAM-dependent methyltransferase  23.2 
 
 
208 aa  85.1  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6157  Methyltransferase type 11  37.76 
 
 
203 aa  85.1  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684724  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1153  SAM-dependent methyltransferase  23.71 
 
 
196 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  28.28 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1467  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.48 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1413  SAM-dependent methyltransferase  23.2 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12710  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.65 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1375  hypothetical protein  22.04 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0314  putative methyltransferase  23.83 
 
 
211 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0633  hypothetical protein  28.22 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.182663  normal  0.273466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 
261 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.93 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.24 
 
 
230 aa  72  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 
273 aa  72  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0798  Methyltransferase type 11  24.34 
 
 
229 aa  71.6  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  35.17 
 
 
256 aa  71.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4221  Methyltransferase type 11  37.19 
 
 
220 aa  71.2  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  35.29 
 
 
832 aa  71.2  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  35.17 
 
 
256 aa  71.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  34.48 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1607  Methyltransferase type 11  36 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  35.17 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.3 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1683  Methyltransferase type 11  36 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.430407  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  39.64 
 
 
233 aa  68.9  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  34.03 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  34.04 
 
 
295 aa  68.6  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2500  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 
221 aa  68.6  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126168  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2109  methyltransferase type 11  39.29 
 
 
296 aa  68.6  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.709004  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  35.56 
 
 
295 aa  68.6  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  34.48 
 
 
256 aa  68.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4115  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  39.2 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  36.57 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  27.56 
 
 
351 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  30.57 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.71 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  39.32 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09381  methyltransferase  30 
 
 
351 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.398692  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1411  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 
292 aa  67  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.456001  normal  0.135358 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2086  hypothetical protein  32.67 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0725  Methyltransferase type 11  38.39 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  35 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  31.49 
 
 
287 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  35.48 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  39.82 
 
 
624 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2205  Methyltransferase type 11  27.63 
 
 
362 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000273998 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.25 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  34.62 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  37.17 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0403  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.43 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  39.09 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0374  demethylmenaquinone methyltransferase  36.43 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  35.07 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0988  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  38.4 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.387372  decreased coverage  0.00000591406 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0402  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.43 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09391  methyltransferase  29.33 
 
 
351 aa  65.5  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2097  hypothetical protein  31.68 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1057  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 
292 aa  64.7  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.783467  hitchhiker  0.00010073 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1836  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
296 aa  64.3  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0149  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.39 
 
 
351 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  37.96 
 
 
276 aa  64.7  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6077  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 
277 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.81 
 
 
256 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3961  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  38.4 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 
281 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
262 aa  64.3  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.81 
 
 
256 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.3 
 
 
256 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  36.8 
 
 
281 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.3 
 
 
245 aa  63.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2086  Methyltransferase type 11  23.9 
 
 
219 aa  63.2  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.39993  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 
272 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.07 
 
 
386 aa  63.5  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  32.32 
 
 
277 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2414  hypothetical protein  31.61 
 
 
351 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177274  normal  0.0190439 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3960  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.19 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  34.18 
 
 
271 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.11 
 
 
237 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  34.97 
 
 
178 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10041  methyltransferase  27.63 
 
 
351 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3296  hypothetical protein  37.5 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.114197  normal  0.0687983 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3145  hypothetical protein  37.5 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.725921  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2776  methyltransferase type 11  32.52 
 
 
279 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3284  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
173 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.859694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>