235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_36280 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_36280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  100 
 
 
243 aa  484  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  43.43 
 
 
283 aa  111  9e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  34.87 
 
 
272 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  33.33 
 
 
270 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  31.96 
 
 
271 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.5 
 
 
272 aa  96.3  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  33.14 
 
 
265 aa  94.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
273 aa  87.8  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6478  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
269 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0560724  normal  0.10851 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  32.95 
 
 
272 aa  85.9  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  33.72 
 
 
275 aa  85.1  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  31.98 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  31.79 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  28.18 
 
 
275 aa  75.5  0.0000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  29.12 
 
 
267 aa  75.5  0.0000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.21 
 
 
296 aa  72.4  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  30.73 
 
 
264 aa  72  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07175  ubiE/COQ5 methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03321)  27.62 
 
 
313 aa  71.2  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38441  normal  0.150354 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  29.35 
 
 
281 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  24.62 
 
 
270 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.16 
 
 
266 aa  58.5  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  34.11 
 
 
255 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  26.86 
 
 
268 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  24.19 
 
 
276 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.57 
 
 
212 aa  56.2  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  33.07 
 
 
243 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  33.07 
 
 
243 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  33.07 
 
 
243 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
276 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3324  methyltransferase type 11  29.73 
 
 
244 aa  55.1  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  33.63 
 
 
377 aa  54.7  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  25.26 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3113  Methyltransferase type 11  30.16 
 
 
350 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00520497  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  32.71 
 
 
244 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  38.05 
 
 
352 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6244  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 
326 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.099736  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  30.25 
 
 
209 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  34.92 
 
 
240 aa  52.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  37.72 
 
 
202 aa  52.8  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  29.89 
 
 
239 aa  52.4  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0636  Methyltransferase type 11  24.72 
 
 
275 aa  52.4  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24189  normal  0.300979 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1849  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 
273 aa  52  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  26.51 
 
 
207 aa  52  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
241 aa  52  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3875  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 
268 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  23.6 
 
 
268 aa  52  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  28.26 
 
 
239 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3984  methyltransferase type 11  33.03 
 
 
245 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.237178  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  28.97 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2791  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.93 
 
 
266 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  32.26 
 
 
249 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  28.26 
 
 
239 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2962  methyltransferase type 11  27.74 
 
 
401 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  26.92 
 
 
265 aa  50.4  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1353  Methyltransferase type 11  33.82 
 
 
280 aa  50.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0337053  hitchhiker  0.000000492717 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1409  methyltransferase type 12  25.6 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  34.13 
 
 
309 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  24.34 
 
 
277 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  26.23 
 
 
344 aa  50.1  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  29.69 
 
 
206 aa  50.1  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  27.54 
 
 
207 aa  49.7  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.26 
 
 
239 aa  49.7  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  27.11 
 
 
241 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  25.5 
 
 
277 aa  49.3  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  30.71 
 
 
237 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  35.16 
 
 
257 aa  49.3  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  22.75 
 
 
268 aa  48.9  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 
205 aa  49.3  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  35.4 
 
 
273 aa  48.9  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2045  Methyltransferase type 11  25 
 
 
267 aa  48.9  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000233397  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2173  Methyltransferase type 11  25.29 
 
 
267 aa  48.5  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.37 
 
 
253 aa  48.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1769  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 
273 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3235  methyltransferase type 11  27.06 
 
 
271 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  32.84 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0591  Methyltransferase type 11  35.44 
 
 
263 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.812194 
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.65 
 
 
280 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.61 
 
 
257 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  27.61 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  33.06 
 
 
168 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  26.83 
 
 
207 aa  47.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  34.55 
 
 
364 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
214 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  23.15 
 
 
268 aa  47  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1110  hypothetical protein  28.96 
 
 
267 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  32.03 
 
 
291 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.81 
 
 
272 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  46 
 
 
239 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  29.5 
 
 
240 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.71 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  26.54 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  27.41 
 
 
278 aa  47.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  34.04 
 
 
237 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.08 
 
 
330 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  33.61 
 
 
215 aa  46.6  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  30.43 
 
 
291 aa  46.6  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
293 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>