267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3235 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3235  methyltransferase type 11  100 
 
 
271 aa  554  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2045  Methyltransferase type 11  55.43 
 
 
267 aa  319  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000233397  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2173  Methyltransferase type 11  55.43 
 
 
267 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1409  methyltransferase type 12  55.22 
 
 
269 aa  295  7e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1020  Methyltransferase type 11  49.42 
 
 
273 aa  266  2e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.833494 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3681  methyltransferase type 11  28.2 
 
 
392 aa  67  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4416  Methyltransferase type 11  31.76 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  30.86 
 
 
272 aa  65.5  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7199  methyltransferase type 11  27.08 
 
 
278 aa  65.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375023  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  29.68 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  31.48 
 
 
270 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 
265 aa  63.5  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  30.25 
 
 
271 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  31.29 
 
 
268 aa  61.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3349  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 
145 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  31.69 
 
 
266 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  34.75 
 
 
278 aa  58.9  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1457  AMP-dependent synthetase and ligase  28.22 
 
 
853 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805076  normal  0.11839 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 
283 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0491  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.06 
 
 
288 aa  57  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 
440 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  29.1 
 
 
208 aa  56.6  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  32.3 
 
 
281 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  24.07 
 
 
269 aa  56.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0056  methyltransferase small domain-containing protein  37.93 
 
 
438 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0610921  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  33.59 
 
 
261 aa  55.8  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1559  putative methyltransferase  37.93 
 
 
370 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1471  putative methyltransferase  37.93 
 
 
431 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443682  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07175  ubiE/COQ5 methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03321)  28.31 
 
 
313 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38441  normal  0.150354 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  37.17 
 
 
348 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  33.02 
 
 
352 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.78 
 
 
272 aa  53.9  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04271  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.91 
 
 
233 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2642  Methyltransferase type 11  24.9 
 
 
390 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350923  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 
273 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 
272 aa  53.9  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  25.31 
 
 
285 aa  53.5  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  23.43 
 
 
270 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 
276 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07641  methyltransferase  28 
 
 
209 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  25.77 
 
 
275 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.4 
 
 
250 aa  53.1  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  33.91 
 
 
233 aa  52.8  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 
272 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.2 
 
 
254 aa  52.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 
208 aa  53.1  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1236  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.55 
 
 
237 aa  52.8  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.228899  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  32.2 
 
 
274 aa  52  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
291 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.07 
 
 
241 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0457  methyltransferase type 11  30.28 
 
 
208 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.07 
 
 
241 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  33.64 
 
 
253 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.46 
 
 
221 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  27.67 
 
 
268 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0714  methyltransferase  32.86 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.46 
 
 
249 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  29.84 
 
 
216 aa  51.2  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1973  demethylmenaquinone methyltransferase  36.11 
 
 
245 aa  50.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  28.79 
 
 
218 aa  50.8  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  34.21 
 
 
312 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  35 
 
 
252 aa  49.7  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2303  Methyltransferase type 11  25 
 
 
390 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.342078  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  28.12 
 
 
276 aa  49.7  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0702  methyltransferase type 11  26.34 
 
 
265 aa  49.7  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136876  normal  0.144201 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2758  demethylmenaquinone methyltransferase  34.82 
 
 
256 aa  49.3  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0515  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.4 
 
 
254 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0440194 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 
270 aa  49.3  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.77 
 
 
254 aa  48.9  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  26.38 
 
 
268 aa  49.3  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1234  hypothetical protein  29.13 
 
 
524 aa  49.3  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0873345 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1032  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.23 
 
 
443 aa  48.9  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0127983  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  33.1 
 
 
269 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0137  methyltransferase type 11  30.28 
 
 
248 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  31.53 
 
 
214 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  25.9 
 
 
275 aa  48.5  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2962  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
401 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0786  hypothetical protein  28.81 
 
 
242 aa  48.1  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.27206  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0289  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  25.35 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2747  hypothetical protein  34.65 
 
 
266 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2620  hypothetical protein  34.65 
 
 
266 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  25.95 
 
 
268 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.29 
 
 
236 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0079  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.6 
 
 
253 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0762202 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0466  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.35 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  25.95 
 
 
268 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.06 
 
 
243 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  26.71 
 
 
267 aa  47.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  33.63 
 
 
273 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.91 
 
 
237 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1423  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.48 
 
 
237 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.48 
 
 
237 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1607  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.48 
 
 
237 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000707225 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1534  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.48 
 
 
237 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1773  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 
265 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6478  methyltransferase type 11  25.31 
 
 
269 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0560724  normal  0.10851 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  30.83 
 
 
342 aa  47  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.48 
 
 
237 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>