More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3349 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3349  Methyltransferase type 11  100 
 
 
145 aa  283  4e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  38.19 
 
 
274 aa  104  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  43.1 
 
 
278 aa  104  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4416  Methyltransferase type 11  46.55 
 
 
264 aa  94  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0786  hypothetical protein  42.99 
 
 
242 aa  90.1  9e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.27206  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  35.04 
 
 
249 aa  76.3  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0672  putative RNA methylase  35.34 
 
 
282 aa  73.6  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0491  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.45 
 
 
288 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7789  Methyltransferase type 11  37.38 
 
 
276 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.527057 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1020  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 
273 aa  68.2  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.833494 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  37.27 
 
 
276 aa  67.4  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3235  methyltransferase type 11  39.81 
 
 
271 aa  67  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2851  Methyltransferase type 11  35.78 
 
 
270 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1409  methyltransferase type 12  37.61 
 
 
269 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1032  methyltransferase type 11  37.39 
 
 
282 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0822126  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0760  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
265 aa  62.8  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481453  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  34.45 
 
 
265 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 
266 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 
190 aa  61.6  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  36.54 
 
 
291 aa  61.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  37.88 
 
 
243 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  40.59 
 
 
239 aa  60.8  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3675  methyltransferase type 11  40 
 
 
287 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  33.93 
 
 
168 aa  60.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 
272 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1159  Methyltransferase type 11  38.83 
 
 
282 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0308306  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  27.78 
 
 
242 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0702  methyltransferase type 11  32.46 
 
 
265 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136876  normal  0.144201 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  35.24 
 
 
269 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  33.33 
 
 
275 aa  58.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1612  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.78 
 
 
356 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3137  methyltransferase type 11  40.78 
 
 
256 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474938  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0425  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.05 
 
 
254 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.500195  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1471  putative methyltransferase  33.33 
 
 
431 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443682  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0056  methyltransferase small domain-containing protein  33.33 
 
 
438 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0610921  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1559  putative methyltransferase  33.33 
 
 
370 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  36.28 
 
 
215 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  35.19 
 
 
285 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2550  methyltransferase type 11  31.13 
 
 
348 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00904798  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0006  hypothetical protein  34.4 
 
 
271 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.868865  normal  0.0557095 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0252  Methyltransferase type 12  37.39 
 
 
227 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.965523  hitchhiker  0.00106675 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  38.26 
 
 
246 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  38.26 
 
 
246 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3829  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 
264 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0896  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 
350 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.26 
 
 
254 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  35.24 
 
 
184 aa  57.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  35.19 
 
 
269 aa  57.4  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0388  Methyltransferase type 11  31.93 
 
 
226 aa  57.8  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0586  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.62 
 
 
346 aa  57.8  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1099  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.86 
 
 
233 aa  57.4  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.729785  normal  0.0384798 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.93 
 
 
237 aa  57.4  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  25.83 
 
 
254 aa  57.4  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4137  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 
265 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50382  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0079  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.58 
 
 
253 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0762202 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 
273 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  33.96 
 
 
271 aa  57  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2318  methyltransferase type 11  35.34 
 
 
349 aa  57  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399773  normal  0.0108051 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 
285 aa  57  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0964  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 
281 aa  57  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0015183  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  35.21 
 
 
263 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2605  hypothetical protein  28.7 
 
 
265 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2045  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 
267 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000233397  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.69 
 
 
250 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.43 
 
 
253 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  32.69 
 
 
261 aa  56.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  37.04 
 
 
267 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.07 
 
 
256 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.67 
 
 
243 aa  55.8  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5802  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.21 
 
 
256 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1457  AMP-dependent synthetase and ligase  33.93 
 
 
853 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805076  normal  0.11839 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2011  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  36.54 
 
 
253 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.3567 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  29.57 
 
 
275 aa  55.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2339  methyltransferase type 11  36.52 
 
 
191 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.755854  normal  0.422901 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.27 
 
 
234 aa  56.2  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  39.81 
 
 
246 aa  55.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  37.93 
 
 
352 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66900  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.21 
 
 
256 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  41.35 
 
 
236 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  34.91 
 
 
240 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4254  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.67 
 
 
272 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  33.33 
 
 
414 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  37.39 
 
 
246 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  34.96 
 
 
210 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0868  methyltransferase type 11  37.38 
 
 
285 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321249  hitchhiker  0.00411338 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1464  Methyltransferase type 12  40.48 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.314215  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2173  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 
267 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  39.81 
 
 
246 aa  54.7  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1973  demethylmenaquinone methyltransferase  34.31 
 
 
245 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  31.78 
 
 
400 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  35 
 
 
252 aa  54.7  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.19 
 
 
248 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 
286 aa  54.7  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  31.78 
 
 
400 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  40 
 
 
251 aa  54.3  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.03 
 
 
237 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.02 
 
 
285 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.03 
 
 
237 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0515  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.64 
 
 
254 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0440194 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
241 aa  54.3  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.874721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>