More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1471 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0056  methyltransferase small domain-containing protein  99.07 
 
 
438 aa  864    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0610921  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1471  putative methyltransferase  100 
 
 
431 aa  871    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443682  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1559  putative methyltransferase  99.46 
 
 
370 aa  744    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1307  hypothetical protein  89.81 
 
 
216 aa  386  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259893  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0672  putative RNA methylase  33.03 
 
 
282 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0491  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.02 
 
 
288 aa  95.5  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  30.88 
 
 
266 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  33.53 
 
 
274 aa  87.8  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  30.6 
 
 
278 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2605  hypothetical protein  24.6 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0786  hypothetical protein  26.5 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.27206  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  35.37 
 
 
249 aa  78.2  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2732  hypothetical protein  24.19 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4416  Methyltransferase type 11  28.51 
 
 
264 aa  77.4  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1234  hypothetical protein  28.1 
 
 
524 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0873345 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.48 
 
 
287 aa  72.8  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.15 
 
 
215 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  35.06 
 
 
269 aa  70.9  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 
415 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0110  methyltransferase type 11  29.84 
 
 
274 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2859  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.85 
 
 
287 aa  67  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  30.48 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  32.22 
 
 
272 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.6 
 
 
209 aa  65.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.33 
 
 
272 aa  65.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
208 aa  65.9  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
284 aa  64.7  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.17 
 
 
248 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.06 
 
 
266 aa  64.3  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  32.31 
 
 
273 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 
298 aa  63.5  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2045  Methyltransferase type 11  29.8 
 
 
267 aa  63.5  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000233397  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0321  demethylmenaquinone methyltransferase  36.43 
 
 
216 aa  63.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  29.57 
 
 
270 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
262 aa  63.5  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2575  Methyltransferase type 11  29.05 
 
 
264 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3565  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
288 aa  63.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  31.17 
 
 
295 aa  63.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
209 aa  63.5  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 
275 aa  63.2  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1657  ribosomal L11 methyltransferase  37.38 
 
 
247 aa  63.2  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08412  hybrid PKS-NRPS (Eurofung)  33.59 
 
 
3930 aa  62.4  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.23 
 
 
268 aa  62.4  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  28.11 
 
 
265 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  33.81 
 
 
270 aa  63.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3675  methyltransferase type 11  32.81 
 
 
287 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.14 
 
 
283 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  30 
 
 
272 aa  62  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1409  methyltransferase type 12  34.21 
 
 
269 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 
288 aa  61.2  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  36.51 
 
 
269 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1457  AMP-dependent synthetase and ligase  28.44 
 
 
853 aa  61.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805076  normal  0.11839 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  28.21 
 
 
275 aa  61.2  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  33.06 
 
 
276 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0760  methyltransferase type 11  28.73 
 
 
265 aa  61.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481453  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  34.21 
 
 
246 aa  60.8  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2173  Methyltransferase type 11  29.14 
 
 
267 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9984  predicted protein  38.83 
 
 
249 aa  60.5  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0507609  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  35.04 
 
 
291 aa  60.5  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  34.46 
 
 
274 aa  60.5  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4839  putative methyltransferase  38.02 
 
 
271 aa  60.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  34.88 
 
 
276 aa  60.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07175  ubiE/COQ5 methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03321)  29.55 
 
 
313 aa  60.1  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38441  normal  0.150354 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.53 
 
 
271 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  32.48 
 
 
267 aa  60.5  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2184  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
293 aa  60.1  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  27.75 
 
 
273 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  34.38 
 
 
271 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  33.07 
 
 
279 aa  59.3  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3235  methyltransferase type 11  38.79 
 
 
271 aa  59.7  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
286 aa  59.3  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1710  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
262 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2791  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.33 
 
 
266 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3189  MCP methyltransferase, CheR-type  36.09 
 
 
297 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00181305  normal  0.0716024 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
273 aa  58.9  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  33.78 
 
 
273 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.58 
 
 
276 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 
624 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0499  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 
264 aa  58.2  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000709402  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3189  methyltransferase type 11  34.71 
 
 
187 aa  57.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9239  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.96 
 
 
263 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  31.82 
 
 
263 aa  57.4  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  29.87 
 
 
280 aa  57.4  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3349  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
145 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4627  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  54.9 
 
 
291 aa  56.6  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951338  decreased coverage  0.00842858 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.42 
 
 
273 aa  56.6  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1514  arsenite S-adenosylmethyltransferase  26.98 
 
 
280 aa  56.6  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.732855  normal  0.394631 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 
263 aa  56.6  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2851  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 
270 aa  56.6  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0947  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.83 
 
 
252 aa  56.6  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.31 
 
 
254 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00700  conserved hypothetical protein  30 
 
 
239 aa  55.8  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2011  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  36.63 
 
 
253 aa  56.2  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.3567 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.65 
 
 
265 aa  56.2  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0894  Methyltransferase type 11  25.12 
 
 
275 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0515  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.37 
 
 
254 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0440194 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0474  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.67 
 
 
257 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0050  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.94 
 
 
471 aa  55.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_5006  predicted protein  30.69 
 
 
270 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0895863  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>