More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7789 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7789  Methyltransferase type 11  100 
 
 
276 aa  558  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.527057 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2762  putative methyltransferase  38.19 
 
 
288 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.778358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5566  methyltransferase type 12  40.08 
 
 
267 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.509991  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2575  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
264 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4137  Methyltransferase type 11  35.6 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50382  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3829  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 
264 aa  93.2  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2851  Methyltransferase type 11  27.71 
 
 
270 aa  92.8  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9239  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32 
 
 
263 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1457  AMP-dependent synthetase and ligase  31.17 
 
 
853 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805076  normal  0.11839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9102  hypothetical protein  30.33 
 
 
268 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3689  Methyltransferase type 12  27.31 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00200869  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0702  methyltransferase type 11  29.34 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136876  normal  0.144201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0760  methyltransferase type 11  28.75 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481453  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2754  Methyltransferase type 12  34.44 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  28.23 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.07 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  27.96 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
215 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  30.32 
 
 
217 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2605  hypothetical protein  24.18 
 
 
265 aa  63.5  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  27.53 
 
 
274 aa  63.9  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4416  Methyltransferase type 11  32.56 
 
 
264 aa  62.4  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2732  hypothetical protein  24.08 
 
 
265 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  31.22 
 
 
272 aa  58.9  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  34.62 
 
 
269 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0650  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
424 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541697  normal  0.369974 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  27.91 
 
 
219 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3349  Methyltransferase type 11  37.38 
 
 
145 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  36.75 
 
 
210 aa  56.6  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  33.6 
 
 
269 aa  56.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.82 
 
 
241 aa  55.8  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.82 
 
 
241 aa  55.8  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6995  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 
224 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0549  Methyltransferase type 11  25 
 
 
201 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1100  methyltransferase type 11  29.91 
 
 
313 aa  55.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0103  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.58 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.881721  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.98 
 
 
232 aa  54.3  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  27.32 
 
 
397 aa  53.9  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2515  methyltransferase type 11  28.87 
 
 
222 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1338  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 
244 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.482498  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  28.57 
 
 
249 aa  53.5  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  34.17 
 
 
253 aa  53.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1436  Methyltransferase type 11  29.38 
 
 
231 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2045  Methyltransferase type 11  25.62 
 
 
267 aa  53.1  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000233397  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0557  Methyltransferase type 11  30.14 
 
 
206 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.36 
 
 
254 aa  52.4  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0491  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.65 
 
 
288 aa  52.4  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7199  methyltransferase type 11  34.07 
 
 
278 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375023  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0056  methyltransferase small domain-containing protein  29.46 
 
 
438 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0610921  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17170  trans-aconitate methyltransferase  30.81 
 
 
255 aa  52.4  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00821566  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0600  methyltransferase type 11  35.9 
 
 
218 aa  52.4  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.93996  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.65 
 
 
234 aa  52  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  41.43 
 
 
208 aa  51.6  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.54 
 
 
252 aa  52  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.81 
 
 
287 aa  52  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1471  putative methyltransferase  29.46 
 
 
431 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443682  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1559  putative methyltransferase  29.23 
 
 
370 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1508  methyltransferase type 12  30 
 
 
228 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543742  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
190 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  27.52 
 
 
261 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1973  demethylmenaquinone methyltransferase  35.35 
 
 
245 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0713  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  25.29 
 
 
374 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.919448  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2266  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.64 
 
 
232 aa  50.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549196  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0808  methyltransferase type 11  32.71 
 
 
182 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0203629 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2173  Methyltransferase type 11  25 
 
 
267 aa  50.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  34.26 
 
 
276 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  35.61 
 
 
352 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0457  methyltransferase type 11  32 
 
 
208 aa  50.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1423  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.63 
 
 
237 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.63 
 
 
237 aa  49.7  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.63 
 
 
237 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.63 
 
 
237 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1607  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.63 
 
 
237 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000707225 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1534  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.63 
 
 
237 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6084  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  30.43 
 
 
229 aa  49.7  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  35.92 
 
 
285 aa  49.7  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1836  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  28.83 
 
 
246 aa  49.7  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.75 
 
 
256 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.63 
 
 
237 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0437  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.41 
 
 
232 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198029  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3776  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.63 
 
 
237 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0393069  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3003  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.41 
 
 
232 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1569  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.63 
 
 
237 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.781622  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0688  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  24.12 
 
 
362 aa  49.3  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2339  methyltransferase type 11  29.2 
 
 
191 aa  49.3  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.755854  normal  0.422901 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 
272 aa  49.3  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0956  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.41 
 
 
247 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2582  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.41 
 
 
247 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1630  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.41 
 
 
232 aa  49.3  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2892  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.41 
 
 
247 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2954  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.41 
 
 
247 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0191  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.41 
 
 
247 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.85 
 
 
236 aa  49.3  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930008  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08531  putative methyltransferase  31.75 
 
 
267 aa  48.9  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1234  hypothetical protein  19.85 
 
 
524 aa  48.9  0.00009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0873345 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  36.94 
 
 
267 aa  48.9  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0559  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.78 
 
 
232 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0997  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.78 
 
 
232 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448482  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2682  Methyltransferase type 11  26.58 
 
 
262 aa  48.9  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1038  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.78 
 
 
232 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>